行と列のクラスタリングを同じにするにはどうすればよいですか(ペアワイズ行列でグループを見つけるなど)。 ドキュメントでは、行または列のクラスタリングをオン/オフにできますが、それは互いに独立しています。seaborn clustermapクラスタの行と列を共同で作成する方法はありますか?
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A
答えて
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リンケージをコンピューティングごとに計算して、それを行と列の両方に入力するように見えます。私のD行列は対称であるため、リンケージは行と列の両方で同じになります。 これは、次のコードで実現できます。
from scipy.cluster.hierarchy import linkage
link = linkage(D) # D being the measurement
seaborn.clustermap(D, row_linkage=link, col_linkage=link)
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たぶん、あなたは最初のD時の相関行列を計算し、その後clustermapをプロットすることができます。
corr_df=D.corr()
seaborn.clustermap(corr_df.as_matrix())
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コードのみの回答は推奨されません。将来の読者がもっと簡単に理解できるように、あなたが何をしているのかを説明してもらえますか? –
@ JohnnyRockex。完了しました。あなたのための –
upvotes:D –