2017-04-04 13 views
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私は、ペプチドライブラリーのアミノ酸組成と頻度のいくつかのグラフを表示しようとしています。アミノ酸頻度のヒストグラム

私はRと同様のものを達成することができ、私はRと基本的なヒストグラムを作成する方法を知っているが、私はしばしばplot in publication

のこの種を参照してください?

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このリンクは、さまざまなプロットタイプを示しています。プラスあなたの質問は少し漠然としています、なぜあなたはすでに標準的なプロットを使用してそれを行っているかを示していないし、あなたが探しているもののように見えるようにそこから改善する方法を尋ねる?あなたはggplot2を検討したいかもしれません –

答えて

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この種の図形は、通常、WebLogoなどのソフトウェアを使用して生成されます。

R wrapper for WebLogoがあります。それは数年前、私はそれがどのくらいうまく動作するかわかりません。

また、ggseqlogo(もっと最近では、かなりよく見えます)とBioconductorパッケージのseqLogoがあります。後者がペプチドを扱うかどうかはわかりません。

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