matplotlibグラフの塗りつぶし軸の上下2色

Question

x軸の上下に部分的にある折れ線グラフがあります。0です。 ラインの上にあるすべての領域を緑色に塗りつぶすにはどうしたらいいですか？

hydropathy_dict = {"I":-0.528, 
     "L":-0.342, 
     "F":-0.370, 
     "V":-0.308, 
     "M":-0.324, 
     "P":-0.322, 
     "W": -0.270, 
     "H": 2.029, 
     "T": 0.853, 
     "E": 3.173, 
     "Q": 2.176, 
     "C": 0.081, 
     "Y": 1.677, 
     "A":-0.495, 
     "S": 0.936, 
     "N": 2.354, 
     "D": 9.573, 
     "R": 4.383, 
     "G": 0.386, 
     "K": 2.101 
     } 
    seq = 'CHCRRSCYSTEYSYGTCTVMGINHRFCC' 
    hydropathy_list = [] 
    plot_x_axis = [] 
    for aa in seq: 
     hydropathy_list.append(hydropathy_dict[aa]) 
    print(acc,hydropathy_list) 
    for i in range(len(hydropathy_list)): 
     plot_x_axis.append(i) 

    plt.plot(plot_x_axis,hydropathy_list) 
    plt.plot([0,len(hydropathy_list)],[0,0]) 
    plt.show() 

Answer 1

これを試してみてください：

import matplotlib.pyplot as plt 
import numpy as np 
from scipy import interpolate 

hydropathy_dict = {"I":-0.528, 
     "L":-0.342, 
     "F":-0.370, 
     "V":-0.308, 
     "M":-0.324, 
     "P":-0.322, 
     "W": -0.270, 
     "H": 2.029, 
     "T": 0.853, 
     "E": 3.173, 
     "Q": 2.176, 
     "C": 0.081, 
     "Y": 1.677, 
     "A":-0.495, 
     "S": 0.936, 
     "N": 2.354, 
     "D": 9.573, 
     "R": 4.383, 
     "G": 0.386, 
     "K": 2.101 
     } 

seq = 'CHCRRSCYSTEYSYGTCTVMGINHRFCC' 
hydropathy_list = [] 
plot_x_axis = [] 
for aa in seq: 
    hydropathy_list.append(hydropathy_dict[aa]) 

#print(seq, hydropathy_list) 
for i in range(len(hydropathy_list)): 
    plot_x_axis.append(i) 

# convert to np array 
hydropathy_list = np.array(hydropathy_list) 
plot_x_axis = np.array(plot_x_axis) 

# densify data for filled color plot 
f = interpolate.interp1d(plot_x_axis, hydropathy_list) 
xnew = np.arange(plot_x_axis[0], plot_x_axis[-1], 0.1) 
ynew = f(xnew) 

plt.plot(plot_x_axis, hydropathy_list)  # blue line 
plt.plot([0, len(hydropathy_list)], [0,0]) # green line 

# use xnew, ynew to plot filled-color graphs 
plt.fill_between(xnew, 0, ynew, where=(ynew-1) < -1 , color='red') 
plt.fill_between(xnew, 0, ynew, where=(ynew-1) > -1 , color='green') 

plt.show() 

編集（コメントでの質問の応答で）

ステートメントwhere=(ynew-1)<-1の内部にはfill_between()があり、numpyの配列としてynewが必要です（単純なリストは機能しません）。

Scipy.interpolate（）は、カーブに沿ってより多くの点を取得するために使用されるため、色はターゲット領域を完全に塗りつぶします。

Answer 2

使用この形式：

import matplotlib.pyplot as plt 

x = range(10) 
plt.fill_between(x,0,100,color='red') 
plt.fill_between(x,0,-100,color='blue') 

plt.show() 

Answer 3

がmatplotlib fill-between demoを見てみましょう ここでは、コードです。それは確かにあなたの質問に答えます。

しかし、あなたのコードにはこれをより難しくするような数字の定義はありません。通常は、次の手順を実行します

fig, ax = plt.figure() 
ax.plot(plot_x_axis, line_1) 
ax.plot(plot_x_axis, line_2) 
ax.fill_between(plot_x_axis, line_1, line_2, color='r') 
ax.fill_between(plot_x_axis, line_2, line_1, color='g')