2017-08-23 5 views
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apeを使用して系統図をプロットすると、チップラベルは完全に整列していません。ここに私のコードと、この問題を表示する画像です:r plyloプロットのブランチラベルを整列

par(lty= 1) 
ape::plot.phylo(phylotree, align.tip.label= T, label.offset = 1, no.margin = T, cex= .55) 

enter image description here

ヒントアライメントは、引数align.tip.label= TRUEを使用して制御することができます。ただし、tip拡張子は、par(lty = 1)を設定しても破線で表示されます。連続した線を得る方法はありますか? 私のファイルツリー:tree

脇に。フォントサイズは完璧な枝の広がりを妨げるようです。ラベルを乱雑にすることなくそれを増やすことはできますか?

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私は私のphylotreeをpastebinned:
はその後、次のコードを実行します。 –

答えて

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my.plot.phylo.rhereをダウンロードし、作業ディレクトリに保存してください。

source("my.plot.phylo.r") 
my.plot.phylo(phylotree, align.tip.label= T, label.offset = 1, 
       no.margin = T, cex= .8, font=10) 

enter image description here

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