クラスタ品質測定

Question

Matlabはクラスタリング手法を評価するための機能を提供していますか？ （クラスターコンパクトとクラスター分離...） またはそれのための任意のツールボックスはありますか？

Answer 1

Matlabにはありませんが、ELKI（Java）には、数十程度のクラスタ品質評価が用意されています。

Answer 2

統計ツールボックスからSilhouette plotを試すことができます。

例については、this documentationを参照してください。

Answer 3

Matlabはシルエットインデックスを提供し、Matlab用のツールボックスCVAP: Cluster Validity Analysis Platformがあります。これは、以下を含む妥当性指標：

• デイヴィス-Bouldin
• Calinski-Harabasz
• ダンインデックス
• R二乗指数
• ユベール・レビン（C-指数）
• Krzanowskiライインデックス
• ハーティガンインデックス
• ルート平方根標準偏差（RMSSTD）インデックス
• 半部分R二乗（SPR）インデックス
二つのクラスタ（CD）インデックス
• 加重間イントラ指数
• 均一性指数
• 分離指数

注間

距離そのお使いのプラットフォームにあらかじめコンパイル済みのLIBRA binariesが必要な場合があります。

Answer 4

MatlabのSilhouetteは、シングルトンクラスターでは奇妙な動作をすることに注意してください。私にとっては、これらのクラスタに0を与えるより合理的なアプローチがあるときに、シングルトンに1のスコアを割り当てます。 Matlabの実装では、クラスターの数をオブジェクトの数として与えると、Silhouetteは1のスコアを与えます。