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MatlabのRで関数を再現しようとしています。私はRの経験があまりないので、コードの一部を理解することは難しいです。ここでRコードは次のとおりです。RからMatlabに関数を変換する
# Model Calculations
# ==================
#
# Function to determine length of stay df.
#
# t = time since hospital admission in days
# age = age at admision in years
# type = type of stroke (1. Haemorhagic, 2. Cerebral Infarction, 3. TIA)
#
los.df <- Vectorize(function(t, age, type,dest){
par <- c(6.63570, -0.03652, -3.06931, 0.07153, -8.66118,
0.08801, 22.10156, 2.48820, 1.56162, 1.27849,
11.76860, 3.41989, 63.92514)
alpha1 <- par[1]
beta1 <- par[2]
alpha2 <- par[3]
beta2 <- par[4]
theta0 <- par[5]
theta1 <- par[6]
mu1 <- par[7]
mu2 <- par[8]
mu3 <- par[9]
mu4 <- 0
nu1 <- 0
nu2 <- 0
nu3 <- par[10]
nu4 <- 0
rho1 <- 0
rho2 <- par[11]
rho3 <- par[12]
rho4 <- par[13]
#
p <- exp(-exp(theta0 + theta1*age))
temp.mat <- matrix(c(1,0,1,0,1-p,p),3,2,byrow=TRUE)
initial.state.vec <- rep(0,7)
initial.state.vec[c(type,type+1)] <- temp.mat[type,]
#
lambda1 <- exp(alpha1 + beta1*age)
lambda2 <- exp(alpha2 + beta2*age)
Q <- matrix(0,7,7)
Q[1,] <- c(-(lambda1+mu1+nu1+rho1), lambda1, 0, 0, mu1, nu1, rho1)
Q[2,] <- c(0, -(lambda2+mu2+nu2+rho2), lambda2, 0, mu2, nu2, rho2)
Q[3,] <- c(0, 0, -(mu3+nu3+rho3), 0, mu3, nu3, rho3)
Q[4,] <- c(0, 0, 0, -(mu4+nu4+rho4), mu4, nu4, rho4)
Pt <- expm(t/365*Q)
Ft <- sum(as.numeric(initial.state.vec %*% Pt)[dest:dest])
return(Ft)
})
は、私は次のコード行を理解するのに困難を持つとその意味しています： temp.mat <- matrix(c(1,0,1,0,1-p,p),3,2,byrow=TRUE) initial.state.vec <- rep(0,7) initial.state.vec[c(type,type+1)] <- temp.mat[type,]
ここで私はRコードを再現しようとしていた中で、私のMatlabのコードがあります：私は出力をプロットすると、それは私が間違っているつもりですどこ私は識別することはできませんR.であるよう
function Ft = losdf(age, strokeType, dest)
% function to determine length of stay in hospitaal of stroke patients
% t = time since admission (days);
% age = age of patient;
% strokeType = 1. Haemorhagic, 2. Cerebral Infarction, 3. TIA;
% dest = 5.Death 6.Nursing Home 7. Usual Residence;
alpha1 = 6.63570;
beta1 = -0.03652;
alpha2 = -3.06931;
beta2 = 0.07153;
theta0 = -8.66118;
theta1 = 0.08801;
mu1 = 22.10156;
mu2 = 2.48820;
mu3 = 1.56162;
mu4 = 0;
nu1 = 0;
nu2 = 0;
nu3 = 1.27849;
nu4 = 0;
rho1 = 0;
rho2 = 11.76860;
rho3 = 3.41989;
rho4 = 63.92514;
Ft = zeros(365,1);
for t = 1:1:365
p = (exp(-exp(theta0 + (theta1.*age))));
if strokeType == 1
initialstatevec = [1 0 0 0 0 0 0];
elseif strokeType == 2
initialstatevec = [0 1 0 0 0 0 0];
else
initialstatevec = [0 0 (1-p) p 0 0 0];
end
lambda1 = exp(alpha1 + (beta1.*age));
lambda2 = exp(alpha2 + (beta2.*age));
Q = [ -(lambda1+mu1+nu1+rho1) lambda1 0 0 mu1 nu1 rho1;
0 -(lambda2+mu2+nu2+rho2) lambda2 0 mu2 nu2 rho2;
0 0 -(mu3+nu3+rho3) 0 mu3 nu3 rho3;
0 0 0 -(mu4+nu4+rho4) mu4 nu4 rho4;
0 0 0 0 0 0 0;
0 0 0 0 0 0 0;
0 0 0 0 0 0 0];
Pt = expm(t./365.*Q);
Pt = Pt(strokeType, dest);
Ft(t) = sum(initialstatevec.*Pt);
end
、それは私のMatlabで同じ値を与えていません。私はPtの値が正しいことを知っています。私はinitialstatevecの設定やFt（t）の定義に誤りがあったと思いますか？
誰かが私がどこに間違っていたかについて私にアドバイスを与えることができれば、これは非常に高く評価されるだろう。