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Ok関数kri3とKmapを1つの関数にしたいと思います。どちらの機能も自分自身で機能します。私が抱えている問題は、2つのkri3を組み合わせると、自分の地球環境で作成した値を保存せずにKmapに渡すということです。このため、Kmapは関数を2つに分割しない限り、値を使用しません。なぜこれを一つの機能にすることができないのですか?私は、この2つではなく、1つの機能だけを持っていたい。2つの関数を1つに変換するR
私が作ろうとしている機能は、地図がx方向とy方向にどれほど鮮明であるかを変数、緯度、経度とします。次に、与えられたデータをクリグし、予測と分散のための2つのヒートマップをggmapにまとめて出力します。
kri3 <- function(var, lat, lon, defx, defy){
#making a data frame out of the given vectors
spdf <- data.frame(var,lat,lon)
#makeing spatial point data frame coords
sp::coordinates(spdf) <- ~ lon + lat
bbox <- sp::bbox(spdf)
#variogram stuff
lzn.vgm <- gstat::variogram(var ~ 1, spdf)
lzn.fit1 <- gstat::fit.variogram(lzn.vgm, model = gstat::vgm(1, "Sph", 900, 1))
lzn.fit = automap::autofitVariogram(var ~ 1,
spdf,
model = c("Sph"),
kappa = c(0.05, seq(0.2, 2, 0.1), 5, 10),
fix.values = c(NA, NA, NA),
start_vals = c(NA,NA,NA),
verbose = T)
#making our grid
cs <- c(defx, defy)
bb <- sp::bbox(spdf)
cc <- bb[,1] + (cs/2)
cd <- ceiling(diff(t(bb))/cs)
gold_grd <- sp::GridTopology(cellcentre.offset = cc, cellsize = cs, cells.dim = cd)
gold_grd
p4s <- sp::CRS(sp::proj4string(spdf))
gold_sg <- sp::SpatialGrid(gold_grd, proj4string = p4s)
summary(gold_sg)
#kringing and auto kriging
lzn.kriged <- as.data.frame(gstat::krige(var ~ 1, spdf, gold_sg , model=lzn.fit1))
lzn.Akriged <- automap::autoKrige(var ~ 1, spdf, gold_sg)
lzn.Akriged.pred <- lzn.Akriged$krige_output$var1.pred
lzn.Akriged.var <- lzn.Akriged$krige_output$var1.var
return(lzn.kriged)
return(lzn.Akriged.var)
return(lzn.Akriged.pred)
}
kriw <- kri3(new_river$E_coli, new_river$lat2, new_river$lon2, 0.005, 0.005)
Kmap <- function(lat, lon, kriw){
#making a dataframe for ggplot
kriw <- as.data.frame(kriw)
#making a maps
bbox1 <- ggmap::make_bbox(lon, lat, f = 1.4)
map <- ggmap::get_map(bbox1)
#making a heat map
M1 <- ggmap::ggmap(map) +
ggplot2::geom_tile(data = kriw, ggplot2::aes(x = lon,
y = lat, alpha = var1.pred), fill = "red")
M2 <- ggmap::ggmap(map) +
ggplot2::geom_tile(data = kriw, ggplot2::aes(x = lon,
y = lat, alpha = var1.var), fill = "red")
#Placing both heat maps together
heat <- gridExtra::grid.arrange(M1,M2, ncol=2)
return(heat)
}
Kmap(new_river$lat2, new_river$lon2, kriw)
'return 'は3回ではなく、関数ごとに1回発生します。あなたが3つすべてを返すには、それらを 'リスト 'として返す必要があります(そして、後でそのように扱います)。 – r2evans