3D TIFF画像からパーツを抽出する方法は？

Question

私は、ImageJを使用してZスタックに配置された複数のグレースケール画像を持ち、3D画像を形成するtiffファイルを持っています。この画像から、特定の物体、すなわち細胞体または軸索を抽出したいと考えている。

私は自動セグメンテーションを探していませんが、手動で目的の領域を選択します。しかし、私は3Dティフ画像で選択を描画し、選択した領域をエクスポートするソフトウェアを見つけることができませんでした。

私の質問は、そのようなソフトウェアがある場合ですか？

Answer 1

あなたが見る、3Dで自動セグメンテーションと測定をperfomできるもののために3Dスイートを使用することができます。

http://imagejdocu.tudor.lu/doku.php?id=plugin:stacks:3d_ij_suite:start

あなたはまた、手動で抽出するためにマークし、あなたのオブジェクトを埋めることができ、スタックを持っている場合と、それらを例えば3Dオブジェクトカウンタ。

別の可能性は、スタック内の同様の領域をマークするために訓練可能なセグメンテーションプラグインを使用することで、参照：

http://imagej.net/Trainable_Weka_Segmentation