ヒートマップ2のゼロ値を値なしとして保持

Question

heatmap2()機能を使用してヒートマップを作成する場合は、gplotsとRcolorbrewerを使用しています。
私のデータには、このサンプルにデータが記録されていないことを示すゼロがあります。ヒートマップを作成するには、これらのゼロを白く塗りつぶし、残りの部分を3色の凡例にします。ここで

コードは、これまでのところです：

my_palette <- colorRampPalette(c("blue", "green", "red"))(n = 299) 
col_breaks = c(seq(0.001,0.2,length=100), seq(0.3,0.4,length=100), seq(0.5,0.6,length=100)) 

library(gplots) 
heatmap.2(deco.hmBB, main = "BCC at day 0 and day 10", margins = c(6,9), trace = "none", 
density.info = "none", dendrogram = "none", col = my_palette, breaks = col_breaks, 
Colv = "NA") 

Answer 1

ようにのようなNASとのゼロを置き換え、次のようにコメントし

deco.hmBB[deco.hmBB == 0] <- NA 

は今na.colorを追加し、ヒートマップを再実行します。

heatmap.2(deco.hmBB, main = "BCC at day 0 and day 10", margins = c(6,9), 
trace = "none", density.info = "none", dendrogram = "none", 
col = my_palette, breaks = col_breaks, Colv = "NA", na.color = "White")