dplyrに問題があります。解決できません。また、問題は完全なデータセット(私はあなたと共有できません)でのみ発生するので、私は完全に実行可能な例はありません。R dplyr:min max関数が突然変異していない
私は、次の操作を行います。
id minbplevel maxbplevel
(dbl) (dbl) (dbl)
1 B 33.0 73.0
2 A 39.4 80.4
につながる。しかし、私は
t %>% group_by(id, add=TRUE) %>%
mutate(minbplevel = min(ref, na.rm=T)
,maxbplevel = max(ref, na.rm=T)
) %>% filter(id %in% c(caseA,caseB))
を行うときには、その結果
t %>% group_by(id, add=TRUE) %>%
summarise(minbplevel = min(ref, na.rm=T)
,maxbplevel = max(ref, na.rm=T)
) %>% filter(id %in% c(caseA,caseB))
:
id Level refparmax refparmin ref meanbptest minbplevel maxbplevel
(dbl) (chr) (int) (int) (dbl) (dbl) (dbl) (dbl)
1 B 0SD 69 68 49.0 52.00000 33 73
2 B min1SD 69 68 41.0 52.00000 33 73
3 B min2SD 69 68 33.0 52.00000 33 73
4 B plus1SD 69 68 59.0 52.00000 33 73
5 B plus2SD 69 68 73.0 52.00000 33 73
6 A 0SD 100 95 56.4 35.33333 NA NA
7 A min1SD 100 95 47.4 35.33333 NA NA
8 A min2SD 100 95 39.4 35.33333 NA NA
9 A plus1SD 100 95 67.4 35.33333 NA NA
10 A plus2SD 100 95 80.4 35.33333 NA NA
NAがAのケースで製作された理由は何ですか?データのサブセットで試すたびに、データの2番目のケースが問題になると思われますが、これはちょうど奇抜です。 この問題を引き起こすのは18850の1つのケースだけですが、問題のケースが残りのものと異なるように識別できるものはありません。
私はこれを解決するために何をすることができますアドバイスをしてください? 私は回避策を考え、集計したデータを作成し、その結果を元のデータとマージすることができます。しかし、私はdplyrが私にこれを一つのステップで行うことができると思った。
add = TRUEオプションを削除または追加しようとしました。それは何の違いもありません。
多分私は間違った方法でこれを使用しています。コメントに基づいて
私が試した:私は、データの一部をマスクする必要が
id ref
4 B 33.0
5 A 39.4
になり
subset(with(t,aggregate(ref~id, t, FUN= min, na.rm=TRUE, na.action= na.pass)),id %in% c(caseA,caseB))
を。
dput(head(subset(t,id %in% c(caseA,caseB)) , 12))
が与える:
を再び私は、変数caseBとcaseAと実際のidを置き換えます。また、これは問題が発生する完全なデータセットでもありません。
structure(list(id = c(caseB, caseB, caseB, caseB, caseB,
caseA, caseA, caseA, caseA, caseA), Level = c("0SD", "min1SD",
"min2SD", "plus1SD", "plus2SD", "0SD", "min1SD", "min2SD", "plus1SD",
"plus2SD"), refparmax = c(69L, 69L, 69L, 69L, 69L, 100L, 100L,
100L, 100L, 100L), refparmin = c(68L, 68L, 68L, 68L, 68L, 95L,
95L, 95L, 95L, 95L), ref = c(49, 41, 33, 59, 73, 56.4, 47.4,
39.4, 67.4, 80.4), meanbptest = c(52, 52, 52, 52, 52, 35.3333333333333,
35.3333333333333, 35.3333333333333, 35.3333333333333, 35.3333333333333
)), .Names = c("id", "Level", "refparmax", "refparmin", "ref",
"meanbptest"), class = c("grouped_df", "tbl_df", "tbl", "data.frame"
), row.names = c(NA, -10L), vars = list(id), drop = TRUE, indices = list(
0:4, 5:9), group_sizes = c(5L, 5L), biggest_group_size = 5L, labels = structure(list(
id = c(caseB, caseA)), class = "data.frame", row.names = c(NA,
-2L), vars = list(id), drop = TRUE, .Names = "id"))
ベースRソリューションでそれを試して、それが 'dplyr' mutateに基づいているかどうかを確認できますか? 'aggregate(ref-id、t、FUN = min、na.rm = TRUE、na.action = na.pass) ' – akrun
私は再現できません。 'caseA'と' caseB'の定義が不足しているため、いずれかのオプションを実行するとエラーになります。フィルタを削除すると、すべての値は 'mutate'の後に発生します。'dput(head(t、12))' –
を使ってポストする必要があります。pkg:dplyrがロードされていても、引用符で囲まれていない 'caseA'と' caseB'のRチョークを編集します。この構造に至るまでの歩みを振り返るべきだと思います。 –