私は休止状態のAmazon EC2マイクロインスタンスをUbuntu 16.04.LTSおよびRStudio（下記sessionInfo()出力）を使って再起動しました（AMIのおかげでLouis Aslett）。最初にAWSインスタンスにssh-ingした後、sudo apt-get updateを実行しました。Java、rJavaをR（xlsxおよび他のパッケージ）用のAWS EC2にインストール
R Studioにいくつかのパッケージ（xlsxなど）をインストールしようとしたとき（一般的な問題と思われるJavaがないためにエラーが発生しました）。私は、1）依存関係をインストールする（例えば、rJava、xlsxjarsのようなxlsx）separately; 2）apt-get install r-cran-rjavaを提案した。here。そして、チェックインストールjava -versionは
OpenJDKのバージョン "1.8.0_131"
OpenJDKのランタイム環境（1.8.0_131-8u131-b11-0ubuntu1.16.04.2-B11を構築）
OpenJDKの64ビットサーバーVM示しました。 （25.131-B11、混合モードを構築する）
同様の問題は、「rJava load error in RStudio/R after “upgrading” to OSX Yosemite」を提案し、ここでは「error: unable to load installed packages...」を、解決策は、R export LD_LIBRARY_PATH=$JAVA_LD_LIBRARY_PATHまたはRのENVを設定するためにJavaのパスをリンクしているように見えたどこされました。変数Sys.setenv(JAVA_HOME='/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server')。
しかし、R CMD javareconf -e明らかにした（私は仮定）、いくつかのより深い問題（see Image）& /またはを実行すると、スニペット：存在しないと
：Javaコンパイラと
R CMD javareconf -e Java interpreter : /usr/lib/jvm/default-java/jre/bin/java Java version : 1.8.0_131 Java home path : /usr/lib/jvm/default-java Java compiler : not present Java headers gen.: Java archive tool: trying to compile and link a JNI program detected JNI cpp flags : detected JNI linker flags : -L$(JAVA_HOME)/jre/lib/amd64/server -ljvm gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c conftest.c -o conftest.o conftest.c:1:17: fatal error: jni.h: No such file or directory compilation terminated. /usr/lib/R/etc/Makeconf:132: recipe for target 'conftest.o' failed make: *** [conftest.o] Error 1 Unable to compile a JNI program The following Java variables have been exported: JAVA_HOME JAVA JAVAC JAVAH JAR JAVA_LIBS JAVA_CPPFLAGS JAVA_LD_LIBRARY_PATH Running: /bin/bashconftest.c：1：17：致命的なエラー： jni.h：そのようなファイルやディレクトリはありません コンパイルが終了しました。/usr/libに/ Rの/ etc/MAKECONF：132：ここでの最善の解決策は、同じディレクトリをチェック
gcc -I/usr/lib/jvm/jdk1.7.0_07/includeを示唆した：ターゲットのためのレシピ 'conftest.oは、' その後、私は疑問 "how to make jni.h be found?" を見つけた
を失敗しましたcd /usr/lib/jvm/とその内容ls --allをリストに示した：
.DEFAULT-javaの
また、私が試してみました
の.java-1.8.0-OpenJDKの-amd64.jinfo ..java-1.8.0-OpenJDKの-amd64の javaの-8- openjdk-amd64sudo apt-get install openjdk-X-jdkgcc: fatal error: no input filesは（それが推奨的回答「 how to make jni.h be found?」の中だった）おそらくパッケージはもう、 『パッケージOpenJDKの-X-JDKを見つけることができません』が存在しません：
実行、gcc -I/usr/lib/jvm/java-1.8.0-openjdk-amd64/includeをもたらしました。
残念ながら、私は固執しており、他の（一見複雑な解決策）を実装するのに十分なほど熟練していません。私は本当にいくつかのヘルプ/入力を感謝します。
R version 3.3.1 (2016-06-21)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 16.04.1 LTS
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C
[3] LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8
[5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8
[7] LC_PAPER=en_US.UTF-8 LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] parallel compiler stats graphics grDevices utils datasets
[8] methods base
other attached packages:
[1] openxlsx_4.0.17 qdapTools_1.3.1 qdapRegex_0.7.2
[4] qdapDictionaries_1.0.6 stringr_1.1.0 stringi_1.1.2
[7] dplyr_0.5.0 tm_0.7-1 NLP_0.1-10
[10] scales_0.4.0 RColorBrewer_1.1-2 ParallelForest_1.1.0
[13] doMC_1.3.4 iterators_1.0.8 foreach_1.4.3
[16] boot_1.3-18 reshape2_1.4.1 glmm_1.1.1
[19] Matrix_1.2-6 mvtnorm_1.0-5 trust_0.1-7
[22] ggplot2_2.1.0 shiny_0.13.2
loaded via a namespace (and not attached):
[1] gtools_3.5.0 slam_0.1-40 lattice_0.20-33
[4] colorspace_1.2-7 htmltools_0.3.5 chron_2.3-50
[7] XML_3.98-1.7 DBI_0.5-1 plyr_1.8.4
[10] munsell_0.4.3 gtable_0.2.0 codetools_0.2-14
[13] httpuv_1.3.3 gender_0.5.1 Rcpp_0.12.7
[16] xtable_1.8-2 gdata_2.17.0 mime_0.5
[19] gridExtra_2.2.1 digest_0.6.10 grid_3.3.1
[22] tools_3.3.1 bitops_1.0-6 magrittr_1.5
[25] RCurl_1.95-4.8 tibble_1.2 data.table_1.10.4
[28] assertthat_0.1 R6_2.2.0 igraph_1.0.1
私は通常別のツールを使うと言っていませんが、代わりに 'readxl'パッケージを使うことを検討できますか？ Javaに依存しないため、これらの頭痛を避けることができます。 – cdeterman
答えと良いアイデアをありがとう。実際には、私は光沢のあるアプリを実行したいと私の（本物の）問題はxlsxではなくqdapです。 – mmatt