Rのオーバーレイ/ホバーサマリー/ツールチップの対話型散布図

Question

私はRのインタラクティブプロットを探していました。私はインタラクティブプロット、特に散布図を作成するパッケージがいくつかありますが、探していますある機能性。

たとえば、this plotです。ボタンの上にマウスを置くと、ポイントの背後にあるデータの小さな数値の要約、つまりツールチップが得られます。

より多くの変数を持つデータセットがある場合、PCAからスコアを探索/視覚化するか、多次元スケーリング（MDS）を行うのが良いことがよくあります。しかし、上記の例のようにインタラクティブな方法でデータをプロットすると、そのポイントを上回るときの要約は、あまりにも多くの情報、すなわち長い数字のリストを与えているわけではない。数値を表示するのではなく、表示するカスタムプロットを生成できる方が良いでしょう。

だから私の質問は次のとおりです。

は、それは1つが散布図にポイントの上に置いたときに視覚的な要約を生成するために、（Rで利用可能なパッケージの一部以内）、可能です。これは、引数としてdata.frameから1行を取るbarplot、またはユーザー指定のプロット関数である可能性があります。

これが可能であれば、MDSの結果をすばやく理解するのに非常に役立ちます。

EDIT：

ここでは、虹彩データセットにMDSを行うためのいくつかのコードである：

library(ggplot2) 
library(plotly) 
d <- dist(iris[,-5]) # euclidean distances between the rows 
fit <- cmdscale(d,eig=TRUE, k=2) # k is the number of dim 

# Put coordinates and original data in one data.frame 
x <- fit$points[,1] 
y <- fit$points[,2] 
pDat <- data.frame(x=x,y=y) 
pDat <- cbind(pDat,iris) 
p <- ggplot(pDat) + geom_point(aes(x,y)) 
ggplotly(p) 

まず、今ツールチップのみのx、y座標を含みます。ツールチップに元の4つの変数の値を格納したいと思います。次に、データポイントの背後にある元の4つの変数の代わりに、ツールチップをバープロットとして表示したいと思います。 MDSはデータポイント間の距離を保存するので、距離が維持されているため、マウスで徐々にマウスを動かすと、バープロットがほとんど変化しません。私の使用例では、各点の後ろに30個の変数があるので、バープロットの要約は30個の数値よりも多くの視覚情報を提供します。

Answer 1

：1点にホバーがどのように見えるとき

library(ggplot2) 
library(plotly) 
p <- ggplot(iris, aes(Sepal.Length, Petal.Length, colour=Species)) + geom_point() 
ggplotly(p) 

情報を表示次

devtools::install_github("bokeh/rbokeh@v0.6.3") 

library(rbokeh) 

iris$sw <- paste0(iris$Sepal.Width * 20, "px") 
iris$pw <- paste0(iris$Petal.Width * 20, "px") 
iris$sl <- paste0(iris$Sepal.Length * 20, "px") 
iris$pl <- paste0(iris$Petal.Width * 20, "px") 

style_str <- "white-space: nowrap; border: 1px solid white; background: steelblue; height: 15px;" 

figure() %>% 
    ly_points(x = Sepal.Width, y = Sepal.Length, color = Species, 
    data = iris, hover = glue::glue(" 
<div> 
    <div style='{style_str} width: @sw'>Sepal width</div> 
    <div style='{style_str} width: @pw'>Petal Width</div> 
    <div style='{style_str} width: @sl'>Sepal width</div> 
    <div style='{style_str} width: @pl'>Petal Length</div> 
</div> 
")) 

ここで何が起きているのですか？rbokehはツールチップとして任意のhtmlを指定できるようにするため、データ値（@swなどで参照）に従って指定された幅のdivを作成して棒グラフを作成します。

上記の例は、単純な棒グラフではうまくいきますが、任意のイメージをツールチップに表示できるようにするには、各データポイントのラスタイメージを事前に生成し、html tooltip（base64でエンコードされた画像をsrcとして持つimgタグ）。

Answer 2

RStudioを使用している場合、プロットパッケージは十分に使いやすいはずです。たとえば ：あなたはrbokehの最新開発版を使用している場合、あなたはあなたが持つの後にあるものを達成することができます