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私はを参照して(同じサイズ(60x60x60)を有する.TIFF 3D画像のセットで計算骨格上にグラフを構築するために、私は、PIPを介してインストールしたPythonでSKNWパッケージを使用していhttps://github.com/yxdragon/sknw):問題は関数「build_sknw(SKE)」は、いくつかのイメージのため、その他のために働くということであるSKNWパッケージエラー
stack = skimage.io.imread('image1.tiff',plugin='tifffile')
ske = skeletonize_3d(stack).astype(np.uint16)
# build graph from skeleton
graph = sknw.build_sknw(ske)
私は、これら2つのエラーのいずれかを取得:
IndexError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-9-f133f5f3fe10> in <module>()
----> 1 graph = sknw.build_sknw(ske)
/usr/local/lib/python2.7/site-packages/sknw/sknw.pyc in
build_sknw(ske)
112 def build_sknw(ske):
113 mark(ske)
--> 114 nodes, edges = parse_struc(ske.copy())
115 return build_graph(nodes, edges)
116
IndexError: index 218852 is out of bounds for axis 0 with size 216000
またはIセグメンテーションフォールトを取得:11エラーとipythonが閉じています。
アイデア?