エラーバーを持つグループのバープロットを作成する

Question

私は、列V2と長さの棒グラフを作成したいと思います。また、各グループの標準偏差を数字からlengthにプロットします。

> head(Length_filter3) 
      V1 V2           V3 length 
1 URS00000081EA snRNA    AAACTCGACTGCATAATTTGTGGTAGTGGG  30 
2 URS00000081EA snRNA    AAACTCGACTGCATAATTTGTGGTAGTGGGG  31 
3 URS00000081EA snRNA   AAACTCGACTGCATAATTTGTGGTAGTGGGGGACT  35 
4 URS0000008112A tRNA   AAACTCGACTGCATAATTTGTGGTAGTGGGGGACTG  36 
5 URS000000812A tRNA AAATGTGGGAAACTCGACTGCATAATTTGTGGTAGTGGGGGACT  44 
6 URS0000008121EA tRNA     AACTCGACTGCATAATTTGTGGTAGTGGG  29 


ggplot(Length_filter3, aes(V2,length)) + geom_bar(stat="identity") 

Answer 1

私はへのエラーバーは存在しないと思われるため（例えば平均として、あなたは要約統計のいくつかの並べ替えを作成するために探していると仮定して、というよりもRNAの種類のすべての合計の長さをプロットしようとしています話す）。

棒グラフでなければならない場合は、値を自分で計算する必要があります。ここで、私は手動で私は（dplyrを使用して）irisデータから必要な範囲を計算しています：

summarizedData <- 
    iris %>% 
    group_by(Species) %>% 
    summarise(
    mean = mean(Petal.Length) 
    , sd = sd(Petal.Length) 
    , low = mean + sd/(sqrt(n())) * qt(0.025, n()-1) 
    , high = mean + sd/(sqrt(n())) * qt(0.975, n()-1) 
) 


ggplot(
    summarizedData 
    , aes(x = Species 
     , y = mean 
     , ymax = high 
     , ymin = low) 
) + 
    geom_bar(stat = "identity") + 
    geom_linerange() 

また、あなたが使用して喜んでいる場合は特に、ggplotがあなたのために仕事をさせることができます代わりにバープロットのポイントとエラーバー（私はこのようにそれを好む傾向にある）

ggplot(
    iris 
    , aes(x = Species 
     , y = Petal.Length) 
) + 
    stat_summary(fun.data = mean_cl_normal) 

好きな場合は、これらのアプローチを組み合わせることもできます。

Answer 2

try FUN function in ggplot stdevを選択してください。