未定義のシンボルompi_mpi_info_null for HDF5 - Ubuntu 16.04

Question

私はUbuntu 16.04でHDF5が必要なパッケージをコンパイルしようとしていました。 HDF5をコンパイルするとき、私はこの問題が発生した：

ImportError: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libhdf5_openmpi.so.10: undefined symbol: ompi_mpi_info_null 

が、これは私がOpenMPIのを持っていないことを示していますか？私もシナプスから確認することを持っているかなり確信して...私はlibopenmpi-devとlibopenmpi1.10がすでにインストールされている...

Answer 1

はImportErrorは、Pythonのエラーのように見えます。あなたが使用しているソフトウェアスタックは何ですか？

アプリケーションコードは並行していますか？ OpenMPIとHDF5の両方が最新であることを確認することをお勧めします。並列が必要ない場合は、HDF5のシリアルバージョンを使用し、h5py（使用している場合）をインストールします。