Picard SortSamスピードアップ？

Question

私はピカードのSortSamをスピードアップする方法を知っていますか？それを実行するには長い時間がかかりますし、GATKはマルチスレッド化できることは知っていますが、Picardの例はまだ見つかりませんでした。

他の人がこの問題にどのように取り組んでいるのだろうか？

Answer 1

残念ながら、ランダムなBAMファイルのソートは、問題の性質上スピードアップすることはできません。そのため、このツールはマルチスレッドを提供しません。