手作りのリストをインストールするRパッケージマネージャー

Question

pip install -r requirements.txtと似たようなものを探していますが、RにはCRANパッケージのリストがあります。それらをインストールしますか？私はパックラットのようないくつかの潜在的な解決策を見てきましたが、具体的には、私がしたいことを手で要求のリストを変更しないと言っています

Answer 1

これを達成するには、単純なスクリプトラッピングpacmanを書くことができます。あなたは1行に1つのパッケージをリストするファイルがある場合たとえば

は、：

dplyr 
ggplot2 
etc 

INPUT.TXT

をあなたはそれにすべてのREQSをインストールするには、このスクリプトのようなものを使用することができます。

installer.R

#!/usr/bin/env Rscript 
library('pacman') 

infile <- commandArgs(trailingOnly=TRUE)[1] 

# check to make sure specified file exists 
if (!file.exists(infile)) { 
    stop("Invalid filepath specified...") 
} 

# get list of packages 
packages <- readLines(file(infile)) 
print(sprintf("Installing: %s", paste0(packages, collapse='\n'))) 

suppressWarnings(p_install(packages, character.only=TRUE)) 

print("Done!") 

使用：

installer.R <packages.txt>

パックマンのいいところは、それが複数のソース（CRAN、bioconductor、githubの、など）からパッケージをインストールする機能を持っており、また指定するために使用することができるということです特定のパッケージバージョン。この単純なスクリプトを拡張して、バージョン要件を含むより複雑なリストを解析することができます。