Plotly Scatter3d（）プロットに特定の線を追加する

Question

私はPlotly Scatter3d()プロットを持っており、これらの間に線を描きたいと思います。物理的に言えば、私はいくつかのノードが債券に結びついているネットワークを持っており、これらの債券を描きたいと思います。それについてどうすればいいですか？

Scatter3d()には、デフォルトの点のみのプロットではなく、ポイントアンドライン散布図を作成するオプションが付属しています（mode='lines+markers'）。それは私が探しているものではありません。私はxyz座標のペアのリストを提供したい、そして私は最後に行のコレクションが欲しい。

def Splot3dPlotly(xyz): 
''' 
3D scatter plot using Plotly. 

:param xyz: (NPx3) array of xyz positions 
:return: A Plotly figure that can now be plotted as usual. 
''' 
xyz = np.reshape(xyz, (int(xyz.size/3), 3)) 
NN = int(sqrt(xyz.shape[0])) 

trace1 = go.Scatter3d(
    x=xyz[:,0], 
    y=xyz[:,1], 
    z=xyz[:,2], 
    mode = 'markers', # 'lines+markers', 
    marker=dict(color=range(NN*NN), colorscale='Portland') 
      ) 

data = [trace1] 
layout = go.Layout(
    margin=dict(
     l=0, 
     r=0, 
     b=0, 
     t=0 
    ) 
) 

fig = go.Figure(data=data, layout=layout) 
return fig 

Answer 1

あなたのラインと第2のトレースを追加することができ、各ペアは、トレースを結ぶからPlotly防ぐためにNoneによって分離されている座標：

は簡単なScatter3d()プロットをプロットするための私の関数です。

import plotly.graph_objs as go 
import plotly 
plotly.offline.init_notebook_mode() 

#draw a square 
x = [0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 1] 
y = [0, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 0] 
z = [0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1] 

#the start and end point for each line 
pairs = [(0,6), (1,7)] 

trace1 = go.Scatter3d(
    x=x, 
    y=y, 
    z=z, 
    mode='markers', 
    name='markers' 
) 

x_lines = list() 
y_lines = list() 
z_lines = list() 

#create the coordinate list for the lines 
for p in pairs: 
    for i in range(2): 
     x_lines.append(x[p[i]]) 
     y_lines.append(y[p[i]]) 
     z_lines.append(z[p[i]]) 
    x_lines.append(None) 
    y_lines.append(None) 
    z_lines.append(None) 

trace2 = go.Scatter3d(
    x=x_lines, 
    y=y_lines, 
    z=z_lines, 
    mode='lines', 
    name='lines' 
) 

fig = go.Figure(data=[trace1, trace2]) 
plotly.offline.iplot(fig, filename='simple-3d-scatter')