mclapplyユーザーの時間が経過時間よりも大きい

Question

Rにparallelパッケージのmclapply機能を使用しようとしています。この関数は、CPUを大量に使用する操作である対数尤度距離を計算してシーケンス行列に値を代入します。

得system.time値は混乱している：

> system.time(mclapply(worksample,function(x){p_seqi_modj(x,worksample[[1]],c(1:17))})) 
    user system elapsed 
29.339 1.242 18.581 

Iはelapsedが凝集時間（user + system）を意味すると考えました。この場合、上記の結果は何を意味し、何時に自分自身を向けるべきですか？私の未完成のバージョンはで、userの時間が少なくなりました。

Answer 1

ヘルプページ?system.timeは、関数によって返される値がクラスproc_timeのオブジェクトであり、?proc.timeに問い合わせる必要があることを示しています。そこ我々は（2つのコアを使用するmclapplyデフォルトは、mc.cores引数を参照してください）ユーザ時間が

cumulative sum of user and system times of any child processes 

ので、あなたのタスクは、各コアの約15S費やしてきていることを学びます。

実際には、proc.time()はプロセスと子時間を分ける5つの要素を返し、印刷で使用される要約方法はユーザーとシステム時間をプロセス+子時間に崩壊させることを示しています。より多くの情報を入手できます。