awkを使用して平均と標準偏差を計算しようとしているときに、ゼロエラーでawkの致命的除算を取り除く方法

Question

"awk：fatal：division by zero attemptempted"というエラーが発生しています。

私のコマンドは

awk '{s+=$3} END{print $2"\t"s/(NR)}' >> mean; 
awk '{sum+=$3;sumsq+=$3*$3} END {print $2"\t"sqrt(sumsq/NR - (sum/NR)^2)}' >>sd 

いずれかがこの問題を解決する方法を知っているんでしょうか？

Answer 1

あなたの問題は...あなたはゼロで割っています。

awk '{s+=$3} END{print $2"\t"s/(NR)}' >> mean; 
awk '{sum+=$3;sumsq+=$3*$3} END {print $2"\t"sqrt(sumsq/NR - (sum/NR)^2)}' >>sd 

最初のコマンドは、EOFまで標準入力から読み取ります。

は、次の2つのコマンドがあります。次に、2番目のコマンドが実行され、標準入力を読み込もうとしますが、空であることが分かります。したがって、0のレコードが読み込まれます。したがって、NRはゼロで、0で割ってクラッシュしています。

単一のコマンドで平均と標準偏差の両方を処理する必要があります。

awk '{s1 += $3; s2 += $3*$3} 
    END { if (NR > 0){ 
       print $2 "\t" s1/NR; 
       print $2 "\t" sqrt(s2/NR - (s1/NR)^2); 
      } 
     }' 

これにより、ゼロ除算のエラーが回避されます。