ファンとしてのigraphオブジェクトのレイアウト[R]

Question

私はの非バイナリツリー構造を持っています。igraphオブジェクトです。

library(igraph) 
df = data.frame(subregion = c("Africa", "Europe", "Asia", "Namibia", "Kenya", "Egypt", "Belgium", "China", "India"), 
     region = c("World", "World", "World", "Africa", "Africa", "Africa", "Europe", "Asia", "Asia")) 
df_graph = graph_from_data_frame(df, directed = F) 
plot(df_graph, layout = layout_as_tree(df_graph, root = "World")) 

等しく異種である同じレベルのノードで三の階層が存在します。今、私はあなたが系統樹でそれを行うことができます同じように、ファンとしてこのグラフをレイアウトしたい：それはだからしかし

df_graph_cl = cluster_fast_greedy(df_graph) 
plot_dendrogram(df_graph_cl, type = "fan") 

は、ノード間の本来の関係は、系統樹に保存されていませんバイナリツリー。どのようにしてファングラフを樹形図に変換せずにグラフをレイアウトするかについての考えはありますか？

Answer 1

私は今、回避策を思いつき、それを共有すると考えました。キーはNEWICK形式にグラフを変換することでした。そのために、私はグラフの深度最初の検索を実行し、NEWICK文字列を作成する少しfunctionを書く必要がありました。例のデータを使用して

は、私が今簡単に行うことができます。所望の出力生成

library(phytools) 
newick = graph_to_newick(df_graph, root = "World") 
df_tree = collapse.singles(read.newick(text = newick)) 
plot(df_tree, type = "fan") 

：