プロットのためのPCA変数の制限

Question

私はデータセットのPCA解析を行っています。変数のPCAの92倍を取得しています。私はちょうど最初の2つのPCA coponentsでそれをプロットしたいと思っていました。 PCA1およびPCA2。

誰もが私にこれを助けることができますか？

biplotには2つしか表示されませんか？または私は解釈と少し混乱している。もしそうなら、それは2つのコンポーネントのためだけです。次に、どのようにPCA3とPCA4をプロットすることができますか？

以下のコードを見てください。

prin_comp <- prcomp(data_wide.pwy_idx, scale. = T) 
    names(prin_comp) 
    prin_comp$center 
    prin_comp$scale 
    prin_comp$rotation[1:5,1:92] 
    biplot(prin_comp, scale = 0) 

PCA成分、変数およびBiplotを添付する。

Answer 1

はい、あなたが見ているだけで最初の2つの主成分は、x-ラベルとy-ラベルにそれらに気づきます。たとえば、の選択肢引数を使用する必要がある他の主成分ペアをプロットするとします。

biplot(prin_comp, choices = 3:4,scale = 0) 
# to plot the third and fourth components 

Answer 2

は3番目と4番目のコンポーネントをプロットする

使用biplot(prin_comp, scale = 0, choices=c(3,4)) ... ?biplot.princompを見てみましょう。