2016-04-28 12 views
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2つのファイルに一致するスクリプトを作成したいと思います。私は常に変更されるファイルを持っていて、ファイルはデータベースとして機能します。ファイルを一致させるためのbashスクリプトの記述方法

入力FILE1:

1 
3 
5 
7 
9 

データベース整合FILE1:

A B C D E F 
1 0.27776079 0.302853938 1.52415756 2.751714059 1.363932416 2.286189771 
2 0.332465 0.777918524 0.705056607 0.484138872 0.443787105 0.848742839 
3 0.941768856 0.19125 0.573714912 0.5040488 0.526207725 1.554118026 
4 1.717348092 0.19642752 0.315945 0.1331712 0.28427498 0.30113875 
5 0.802253697 0.3768849 0.426688 0.27693 0.591697038 0.3832675 
6 0.2752232 0.570078 0.3847095 0.659548575 0.327469824 0.3346875 
7 0.153272 0.36594447 0.19125 0.526602427 0.44771265 0.31136 
8 0.637448551 0.735756919 1.284158594 0.464060016 0.259459816 0.887975536 
9 0.397221469 0.20808 0.268226 0.710250679 0.493069267 0.47672443 
10 0.196928 0.492713856 0.22302 0.783853054 0.303534 1.736908487 
11 0.510789888 0.14948712 0.26432 0.684485438 0.683017627 0.614033957 

所望の出力FILE1:

A B C D E F 
1 0.27776079 0.302853938 1.52415756 2.751714059 1.363932416 2.286189771 
3 0.941768856 0.19125 0.573714912 0.5040488 0.526207725 1.554118026 
5 0.802253697 0.3768849 0.426688 0.27693 0.591697038 0.3832675 
7 0.153272 0.36594447 0.19125 0.526602427 0.44771265 0.31136 
9 0.397221469 0.20808 0.268226 0.710250679 0.493069267 0.47672443 

Iは、データベースからマッチラインを抽出したいです。

head -1 database1.txt > output1.txt 
grep -wf inputfile1.txt database1.txt >> output1.txt 
head -1 database1.txt > output2.txt 
grep -wf inputfile2.txt database1.txt >> output2.txt 
head -1 database2.txt > output3.txt 
grep -wf inputfile3.txt database2.txt >> output3.txt 

私はnanoコマンドを使用しようとしますが、毎回構文を変更する必要があります。

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例入力と所望の出力が参考になります。 –

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@JohnZwinckごめんなさい、私は今より明確であることを願っています。ご助力ありがとうございます! –

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[diff](http://www.gnu.org/software/diffutils/manual/diffutils.html#Output-Formats)を調べましたか? – Jens

答えて

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あなたは1列目の2つのファイルを結合するためにjoinコマンドを使用することができます。

$ cat file1 
1 
3 
5 
7 
9 
$ cat file2 
A B C D E F 
1 0.27776079 0.302853938 1.52415756 2.751714059 1.363932416 2.286189771 
2 0.332465 0.777918524 0.705056607 0.484138872 0.443787105 0.848742839 
3 0.941768856 0.19125 0.573714912 0.5040488 0.526207725 1.554118026 
4 1.717348092 0.19642752 0.315945 0.1331712 0.28427498 0.30113875 
5 0.802253697 0.3768849 0.426688 0.27693 0.591697038 0.3832675 
6 0.2752232 0.570078 0.3847095 0.659548575 0.327469824 0.3346875 
7 0.153272 0.36594447 0.19125 0.526602427 0.44771265 0.31136 
8 0.637448551 0.735756919 1.284158594 0.464060016 0.259459816 0.887975536 
9 0.397221469 0.20808 0.268226 0.710250679 0.493069267 0.47672443 
10 0.196928 0.492713856 0.22302 0.783853054 0.303534 1.736908487 
11 0.510789888 0.14948712 0.26432 0.684485438 0.683017627 0.614033957 
$ sed -n '1p' file2 && join --nocheck-order file1 <(sed -n '1!p' file2) 
A B C D E F 
1 0.27776079 0.302853938 1.52415756 2.751714059 1.363932416 2.286189771 
3 0.941768856 0.19125 0.573714912 0.5040488 0.526207725 1.554118026 
5 0.802253697 0.3768849 0.426688 0.27693 0.591697038 0.3832675 
7 0.153272 0.36594447 0.19125 0.526602427 0.44771265 0.31136 
9 0.397221469 0.20808 0.268226 0.710250679 0.493069267 0.47672443 
$ 
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'sed'私にとっては 'join -t '' file1 file2'のように働いていました。 –

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スクリプトはsed -n '1p' file2 && join --nocheck-order file1 <(sed -n '1!p' file2)ですか?しかし、file1に10種類のファイルがある場合はどうなりますか? –

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はい、あなたが1つ以上のファイルの場合、 'file1'の代わりに' <(cat file {1..10}) 'を使うことができます – ritesht93

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