Linuxで実行されているDeployRサーバーにRパッケージをインストールする方法（Amazon EC2でホストされています）？

Question

Amazon EC2インスタンスでホストされているRedhat LinuxにDeployRを正常にインストールしました。私は正常にDeployRランディングページに行き、Diagnosticsタブをチェックして、DeployRが実行中であり、正常に表示されていると言います。

私は、単純なRスクリプトをテストし、DeployRに細かい動作しますが、今私はRJDBCパッケージをインストールする必要がありました：ドキュメントは、パッケージのための明確ではないinstall.packagesは（「RJDBC」、DEP = TRUE）

管理：https://deployr.revolutionanalytics.com/documents/admin/r-package-mgmt/

「このRスクリプトをDeployRグリッドノードで手動で実行してください。しかし、グリッドノードでスクリプトを実行する方法がわからない。グリッドノードにアクセスするにはどうすればよいですか？

一般に、DeployRのパッケージのインストール方法に関するガイダンスが必要です。

Answer 1

DeployRインストール用のサーバが1つだけの場合、「グリッドノード」はこのサーバを意味します.SSH（またはDeployRのものにアクセスできる他の方法）に移動して必要な処理を実行します。

Linux上DeployRで最も典型的な問題はDeployRは、ソースコードとしてCRANリポジトリから取得するRパッケージをコンパイルし、構築に必要な開発パッケージ（これらは-develサフィックスを持っている）、（の可用性であることは、Windowsとの主な違いだと事前にコンパイルされたパッケージバイナリを持つMac OSX）。

最も簡単な方法は、必要な開発RPMをインストールし、いくつかのライブラリー（-ies）（例えばxまたはcurlまたは他のなめらか）が利用できない程度がエラーメッセージ（複数可）を見つけ、RServeログ（例えば<deployr_home>/deployr/8.0.0/rserve/R/log）を見ることです（私の例ではyum install xz-develまたはyum install libcurl-devel）。

エラーメッセージから必要なパッケージ名を見つけることは時々非常に難しいことです。これを行うには、さまざまな方法があります（例： yum search RedHatベースのディストリビューションにあるコマンド、またはhttp://rpm.pbone.net/のWebサイトで、パッケージ名を知っていればパッケージ名を見つけることができます。エラーメッセージがcurl-config: command not foundと表示された場合は、rpm.pbone.netにあるcurl-configファイルを探して、対応するパッケージ名が何であるかのヒントを得ることができます。

• PCRE-develの
• XZ-develの
• bzip2でdevelの
• のzlib：ここ

  は、私はAmazonでのLinux AMIで使用することをDeployRのためのいくつかの最も頻繁に使用される開発パッケージのリストです-devel

• libicu-develの
• のlibstdC++ - develの
• libcur L-develの
• のlibxml2-develの

アマゾンのLinuxはRedHatのディストリビューションに基づいているため、これらのパッケージ名は、あなたに合う必要があります。