2013-07-14 9 views
5

単変量のリプリーズのKポイントパターン分析の結果に矛盾があるようです(図1)。まず、1x1の一点グリッドを生成して、Rスクリプトが論理的な結果を出すかどうかを確認しました(図2)。研究領域は20x40です(図2)。完全に均一なデータが与えられていれば、任意の探索距離(r)でランダムまたはクラスタリングされたポイントパターンを見ることは期待できません。添付されたスクリプトを使用してこれらの結果を生成しました。これらの制御された条件のもとで、均一なポイントパターンだけが必要なときに、クラスタリングとCSRが表示されるのはなぜですか?均一な空間データでCSRとクラスタリングを考慮する方法は?

require(spatstat) 
require(maptools) 
require(splancs) 

# Local Variables 
flower = 0 
year = 2013 

# Read the shapefile 
sdata = readShapePoints("C:/temp/sample_final.shp") #Read the shapefile 
data = sdata[sdata$flow_new == flower,] # subset only flowering plants 
data2 = data[data$year == year,] # subset flowering plants at year X 
data.frame(data2) # Check the data 

# Get the ripras estimate of area based on the study area measurements 
gapdata = readShapePoints("C:/temp/study_area_boundary.shp") #Read the shapefile 
whole = coordinates(gapdata) # get just the coords, excluding other data 
win = convexhull.xy(whole) # Ripras will determine a good bounding polygon for the points (usually a variant of Convex Hull) 
plot(win) 

# Converting to PPP 
points = coordinates(data2) # get just the coords, excluding other data 
ppp = as.ppp(points, win) # Convert the points into the spatstat format 
data.check = data.frame(ppp) # Check the format of the ppp data 
summary(ppp) # General info about the created ppp object 
plot(ppp) # Visually check the points and bounding area 

# Now run the ppa 
L.Env.ppp = envelope(ppp, Lest, nsim = 1000, correction = "best", rank =1) 
plot(L.Env.ppp, main = "Uniform Test") 
abline(v=(seq(1:12)), lty="dotted") 

図1

enter image description here

分析の結果

図2

enter image description here

均一点と窓

+3

これらのポイントは定期的に分散されています(過分散されたものもあります)。植木鉢のような意味では統一されていますが、それらの根底にあるポイントプロセスは一様ではありません。そうであれば、ポイントペアが1単位未満離れている可能性があります。リプリーズのKは、その均一性からの短距離逸脱に注意を引くように設計されているように正確に機能しています。 (ちなみに、あなたの井戸が建設され、質問された場合+1)。 –

+0

素晴らしい、洞察力のある情報のおかげで@ジョシュ! – Borealis

+0

ああ良い。喜んで助けた。 –

答えて

3

これらのポイントは、定期的に分散(時にはと呼ばれるがをhyperdispersed)です。口語的な意味では一様に見えるが、の基になるポイントプロセスはであり、それ自体は一様ではない。もしそうであれば、ポイントペアが1単位未満離れている可能性がある。

リプリーズのKは、その短距離の均一性からの偏差に注意を向けて、設計されたとおりに正確に動作しています。

関連する問題