MySQLのジャンクションテーブルに遺伝子発現データを格納する必要はありますか？

Question

私はMySQLに保存したい遺伝子発現データの数m×nの行列を持っています。

メートルを約3万遺伝子（一意に識別）
nは約3,000サンプル（主に一意に識別）

私は最善の方法は、これらのデータを格納することが何であるかはよく分からないです。私は最初に行列をMySQLテーブルに直接読み込んでいましたが、カラム数（サンプル数）が可変であるため、これは素晴らしい方法ではないと言われてきました。行列を転置して格納することはできません。なぜなら、列を作成するときにMySQLが許すよりも多くの遺伝子があるからです。

私はこれまで、「接合テーブル」がこれを行うためのよりよい方法であるかもしれないと言われてきました。しかし、これらのいくつかのYouTubeのビデオを見た後、私は誰も賢明ではない。また、Googleで検索しましたが、ジャンクションテーブルを使用してMySQLに遺伝子発現データを格納する方法についてのチュートリアルはないようです。だから、誰もこれらのデータをどのようにして保存するのがよいかについてアドバイスをしていますか？私は正直なところ、これに関する巨大な文献があると予想していました。有用なリンクがあれば、それも高く評価されます。あなたは、このためのちょうどいくつかのテーブルを必要とする

Answer 1

は、私はMySQLの構文を使用しています：サンプルで発生するすべての遺伝子について

CREATE TABLE genes (
`gene_id` INT NOT NULL AUTO_INCREMENT PRIMARY KEY, 
`gene_name` varchar(99) not null 
)ENGINE=InnoDB; 

CREATE TABLE samples (
`sample_id` INT NOT NULL AUTO_INCREMENT PRIMARY KEY, 
`sample_name` varchar(99) not null 
)ENGINE=InnoDB; 

CREATE TABLE gene_sample (
`gene_id` INT NOT NULL, 
`sample_id` INT NOT NULL, 
FOREIGN KEY(`gene_id`) REFERENCES genes (`gene_id`), 
FOREIGN KEY(`sample_id`) REFERENCES sample (`sample_id`), 
)ENGINE=InnoDB; 

を、gene_sampleテーブルにgene_idとsample_idのペアを挿入します。

2本使用は、SELECTでの表現は、完全なデータを再構築するために、JOIN：

SELECT genes.*, samples.* 
FROM gene_sample 
LEFT JOIN genes USING (gene_id) 
LEFT JOIN samples USING (sample_id);