文字列を含む文字列の一部を削除しようとしています。たとえば、文字列が "atgtga"の場合、出力を "atg"にします。 私は.replace( "tga"、 "")メソッドを使用しようとしましたが、私のTAはそれを削除する代わりに文字列のその部分だけをマスクすると言っていました。文字列内の文字列を削除する
私は新しいアプローチを試みましたが、私はまだifステートメントに固執しています。
x="atgtgaacttaa"
c=0
q=3
while(q<=len(x)):
x=x[c:q]
if(x=="tga" or x=="taa" or x=="tag"):
c=c+3
q=q+3
print(x)
私は新しい関数を作ってみましたが、私の出力は、何らかの理由で、「ATG」を無視して、それを削除しています。
def get_orf(dna_seq):
x=0
while(x<=len(dna_seq)):
if("taa" in dna_seq or "tag" in dna_seq or "tga" in dna_seq):
dna_seq=dna_seq.replace("taa","")
dna_seq=dna_seq.replace("tag","")
dna_seq=dna_seq.replace("tga","")
return dna_seq
else:
return dna_seq
x=x+1
TAが間違っています。 – Shadow