2017-06-01 14 views
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私は2つのクラス(死んで生きている)を持つデータベースを持っており、各クラスの特定のフィーチャの分布グラフをプロットしたいと思います。このような2つのクラスの分布密度をプロットするR

enter image description here

あなたは助けることができますか?

再現データセット:

dput(データ[1:100])もちろん

structure(list(`dead` = structure(c(1L, 1L, 1L, 
1L, 1L, 1L, 2L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 
1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 
1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 
1L, 2L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 
1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 1L, 1L, 1L, 1L, 
1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 
1L), .Label = c("no", "yes"), class = "factor"), `Magnesium` = c(2.17, 
2.31, 2.14, 2.28, 2.17, 1.83, 1.9, 1.94, 2.68, 1.66, 2.14, 2.64, 
2.41, 2.19, 1.46, 2.34, 1.57, 2.52, 1.97, 1.8, 2.36, 1.6, 2.02, 
2.07, 1.44, 2.09, 2.08, 2.02, 2.52, 1.87, 2.72, 2.52, 1.58, 2.52, 
1.75, 2.81, 2, 1.83, 3.35, 1.74, 2.19, 2.44, 1.91, 2.33, 2.23, 
2.03, 2.13, 2.19, 2.02, 1.96, 2.52, 2.77, 2.17, 1.67, 2.04, 2.32, 
1.34, 1.75, 2.07, 2.23, 1.78, 2.69, 2.02, 3.1, 2.18, 1.61, 2.2, 
2.02, 2.3, 2, 2.45, 2.13, 1.96, 1.98, 2.1, 3.38, 1.36, 2.04, 
1.52, 3.12, 2.07, 2.68, 2.18, 2.59, 2.07, 1.77, 2.02, 2.31, 2.23, 
3.79, 1.41, 2.3, 1.97, 1.84, 1.95, 2.43, 2.17, 1.79, 1.7, 2.18 
)), .Names = c("dead", "Magnesium" 
), row.names = c(NA, 100L), class = "data.frame") 
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あなたが再生可能なデータ・セットといくつかのコードを、あなたと私たちを提供する場合それが参考になりますこれまでに試したことがあります。 –

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@Adam Quek私はコードを作成しないように作成する方法はわかりませんが、再現可能なデータセットを追加しました。私は不均衡の問題があります。 – anat

答えて

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d_list <- split(dat, dat$dead) 
d_list <- lapply(d_list, function(x)density(x[, "Magnesium"])[c("x", "y")]) 
d_list <- lapply(d_list, function(x) do.call(data.frame, x)) 

plot(d_list[[1]], type="n", xlab="Magnesium", ylab="Density", main="Magnesium Level of two classes of patients") 
for(i in seq(length(d_list))) lines(d_list[[i]], col=c("black", "red")[i], lty=i) 
legend("topright", names(d_list), lty=1:2, col=c("black", "red")) 

enter image description here

、それが道容易になりますin ggplot

ggplot2
ggplot(dat, aes(Magnesium, col=dead, fill=dead)) + 
    geom_density(alpha=.5) 

enter image description here

1

dfと仮定すると、あなたのデータフレームである):

library(ggplot2) 
ggplot(df) + 
    geom_density(aes(x = Magnesium, 
        group = dead, 
        color = dead, 
        fill = dead), 
       alpha = .2, 
       size = .25) + 
    scale_fill_discrete('', labels = c('Alive', 'Dead')) + 
    scale_color_discrete('', labels = c('Alive', 'Dead')) + 
    scale_x_continuous(limits = c(0, NA)) + 
    theme_minimal() 

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