2017-01-08 16 views
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データフレームに格納された値を使用して合成データセットを生成したいとします。私はこの使用してdplyrを作ることができるか疑問に思う、別のデータフレームの値を使用してデータフレームを作成するR

sp = ' 
species CE_mean Ph_mean  n 
Apocal 0.6398000 6.233600 200 
Aporos 0.6334615 6.518269 156 
Apotra 0.8448980 6.561224 49 
' 
msp <- read.table(text=sp,header = TRUE) 

spdf <- data.frame() 

for(i in 1:nrow(msp)) 
{ 
    spm1 <- data.frame() 
    spm1$CE <-rlnorm(n=msp$n[i],meanlog=msp$CE_mean[i],sdlog=0.1) 
    spm1$Ph <-rlnorm(n=msp$n[i],meanlog=msp$Ph_mean[i],sdlog=0.1) 
    spm1$species <- msp$species[i] 
    spdf<-rbind(spdf,spm1) 
} 

しかし、それは動作しません:新しいデータフレームでは、私は必要なのn指定された平均値と対数正規ランダムな分布からの行は、私はこれを試してみました。

答えて

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spdf <- msp %>% rowwise() %>% 
    do(data.frame(species = .$species, 
     CE=rlnorm(n=.$n,meanlog=.$CE_mean,sdlog=0.1), 
     Ph=rlnorm(n=.$n,meanlog=.$Ph_mean,sdlog=0.1), 
     stringsAsFactors=FALSE)) %>% 
    ungroup() 

万一収量:

species  CE  Ph 
* <fctr> <dbl> <dbl> 
1 Apocal 2.168593 538.4061 
2 Apocal 1.868780 535.1687 
3 Apocal 1.993015 503.7631 
4 Apocal 1.764942 495.0502 
5 Apocal 1.671921 503.3961 
6 Apocal 2.013073 464.7946 
7 Apocal 2.190407 538.6861 
8 Apocal 1.668348 479.1846 
9 Apocal 2.018912 443.7977 
10 Apocal 1.802224 635.2461 
# ... with 395 more rows 

これが役立ちます。

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私は確信していませんdplyrここで最善のアプローチです。

spdf <- data.frame() 
for(i in 1:nrow(msp)) { 
    CE <-rlnorm(n=msp$n[i],meanlog=msp$CE_mean[i],sdlog=0.1) 
    Ph <-rlnorm(n=msp$n[i],meanlog=msp$Ph_mean[i],sdlog=0.1) 
    species <- msp$species[i] 
    spdf<-rbind(spdf,data.frame(CE=CE,Ph=Ph,species=species)) 
} 

か:あなたがして、コードを修正することができますset.seed(123)

spdf <- do.call(rbind,lapply(1:nrow(msp),function(i) data.frame(CE=rlnorm(n=msp$n[i],meanlog=msp$CE_mean[i],sdlog=0.1), 
                   Ph=rlnorm(n=msp$n[i],meanlog=msp$Ph_mean[i],sdlog=0.1), 
                   species=msp$species[i]))) 

、私が取得:これはdplyrソリューションです

set.seed(123) 
spdf 
##   CE  Ph species 
##1 1.792753 634.9086 Apocal 
##2 1.852956 581.0526 Apocal 
##3 2.215927 496.2528 Apocal 
##4 1.909518 538.0327 Apocal 
##5 1.920775 488.9039 Apocal 
## ... 
##195 1.663161 481.1812 Apocal 
##196 2.315258 592.2863 Apocal 
##197 2.013493 471.6256 Apocal 
##198 1.673091 554.5590 Apocal 
##199 1.783688 449.2285 Apocal 
##200 1.684135 491.8362 Apocal 
##201 1.870313 673.9387 Aporos 
##202 1.676312 642.6347 Aporos 
##203 1.768243 664.1729 Aporos 
##204 1.878695 636.0716 Aporos 
##205 2.014822 623.2107 Aporos 
## ... 
##352 1.742361 618.8405 Aporos 
##353 2.105457 692.9110 Aporos 
##354 1.931784 730.0238 Aporos 
##355 2.222545 753.2359 Aporos 
##356 1.628345 663.1387 Aporos 
##357 2.306046 752.1002 Apotra 
##358 2.307643 752.1086 Apotra 
##359 2.688663 597.0578 Apotra 
##360 2.604928 733.6985 Apotra 
##361 2.530301 778.9991 Apotra 
## ... 
##401 2.575855 717.4006 Apotra 
##402 2.281315 701.8091 Apotra 
##403 1.898625 877.7533 Apotra 
##404 2.282586 726.9484 Apotra 
##405 2.456843 696.0313 Apotra