RStudioを使用してbiocLite（ "affy"）でread.affybatch（）関数を使用できないのはなぜですか？

Question

read.affybatch()コマンドを使用して開こうとしているデータがのAffymetrix個あります。私は問題なくbiocLiteとaffyパッケージをダウンロードしている、しかし、すぐに私がしようとすると、リードコマンドを使用して、私の.CELファイルを読み込むと、それは次のような問題を思い付く：

Library - package hgu133acdf not installed 
Library - package hgu133acdf not installed 
In addition: Warning messages: 
1: In read.affybatch(filenames = "MonoHypo_U133A_04_12_03.CEL", "MonoC_U133A_04_12_03.CEL", : 
    Incompatible phenoData object. Created a new one. 

2: running command '"C:/PROGRA~1/R/R-33~1.2/bin/x64/R" CMD INSTALL -l "C:\Program Files\R\R-3.3.2\library" C:\windows\TEMP\RtmpKKBTXV/downloaded_packages/hgu133acdf_2.18.0.tar.gz' had status 1 
3: In install.packages(cdfname, lib = lib, repos = biocinstallRepos(), : 
    installation of package ‘hgu133acdf’ had non-zero exit status 
4: missing cdf environment! in show(AffyBatch) 
5: running command '"C:/PROGRA~1/R/R-33~1.2/bin/x64/R" CMD INSTALL -l "C:\Program Files\R\R-3.3.2\library" C:\windows\TEMP\RtmpKKBTXV/downloaded_packages/hgu133acdf_2.18.0.tar.gz' had status 1 
6: In install.packages(cdfname, lib = lib, repos = biocinstallRepos(), : 
    installation of package ‘hgu133acdf’ had non-zero exit status 

ので、問題はこれのようですhgu133acdfパッケージが、私は次のエラーを取得、このパッケージをインストールするBioConductorからのコマンドを使用して：私はbiocLite("hgu133acdf", lib="C:/Program Files/R/R-3.3.2/library")が、同じを使用して、私のローカルドライブにhgu133acdfをインストールしようとしている

biocLite("hgu133acdf") 
BioC_mirror: https://bioconductor.org 
Using Bioconductor 3.4 (BiocInstaller 1.24.0), R 3.3.2 (2016-10-31). 
Installing package(s) ‘hgu133acdf’ 
installing the source package ‘hgu133acdf’ 

trying URL 'https://bioconductor.org/packages/3.4/data/annotation/src/contrib/hgu133acdf_2.18.0.tar.gz' 
Content type 'application/x-gzip' length 1732200 bytes (1.7 MB) 
downloaded 1.7 MB 

'\\filestore.soton.ac.uk\users\rl1e15\mydocuments\PhD\PhD Year 1 2016-2017\Analysis\In Silico\R\Hypoxia and Normoxia Monocytes' 
CMD.EXE was started with the above path as the current directory. 
UNC paths are not supported. Defaulting to Windows directory. 
ERROR: unable to create 'C:/Program Files/R/R-3.3.2/library/hgu133acdf' 

The downloaded source packages are in 
    ‘C:\Windows\Temp\RtmpKKBTXV\downloaded_packages’ 
Warning messages: 
1: running command '"C:/PROGRA~1/R/R-33~1.2/bin/x64/R" CMD INSTALL -l "C:\Program Files\R\R-3.3.2\library" C:\windows\TEMP\RtmpKKBTXV/downloaded_packages/hgu133acdf_2.18.0.tar.gz' had status 1 
2: In install.packages(pkgs = doing, lib = lib, ...) : 
    installation of package ‘hgu133acdf’ had non-zero exit status 

をが立ち上がります。ときどき私はnlmeを更新する必要があると言いますが、nlme_3.1-130はR-3-3-2と互換性がありません。また、パッケージを更新してもまだ動作しません。

Answer 1

誰かが好奇心があった場合、Rで何時間も遊んだ後、私は最終的に解決策を見つけました。私は仕事用ラップトップを持っているので、管理者権限は自動的に許可されないので、すべてのパッケージがダウンロードできるようにディレクトリのセキュリティを設定します。私はRを管理者として走らせ、read.affybatch（）コマンドを試したときにフラグを立てていたすべての必要なパッケージをインストールしました。