Open CV（Python） - 脳腫瘍の異常な形状ブロブの検出

Question

Open CVでブロブ検出の脳腫瘍を特定しようとしていますが、これまでのところ、Open CVは脳MRIの小さなサークルのみを検出しますが、 。ここで

はコードです：

import cv2 
from cv2 import SimpleBlobDetector_create, SimpleBlobDetector_Params 
import numpy as np 

# Read image 
def blobber(filename): 
    im = cv2.imread(filename, cv2.IMREAD_GRAYSCALE) 

    # Set up the detector with default parameters. 
    detector = cv2.SimpleBlobDetector_create() 

    params = cv2.SimpleBlobDetector_Params() 

    # Filter by Area. 
    params.filterByArea = True 
    params.minArea = 50 

    # Filter by Circularity 
    params.filterByCircularity = True 
    params.minCircularity = 0 

    # Filter by Convexity 
    params.filterByConvexity = True 
    params.minConvexity = 0.1 

    # Create a detector with the parameters 
    ver = (cv2.__version__).split('.') 
    if int(ver[0]) < 3 : 
     detector = cv2.SimpleBlobDetector(params) 
    else : 
     detector = cv2.SimpleBlobDetector_create(params) 

    # Detect blobs. 
    keypoints = detector.detect(im) 

    # Draw detected blobs as red circles. 
    # cv2.DRAW_MATCHES_FLAGS_DRAW_RICH_KEYPOINTS ensures the size of the circle corresponds to the size of blob 
    im_with_keypoints = cv2.drawKeypoints(im,keypoints,np.array([]),(0,0,255),cv2.DRAW_MATCHES_FLAGS_DRAW_RICH_KEYPOINTS) 

    # Show keypoints 
    cv2.imshow("Keypoints", im_with_keypoints) 
    cv2.waitKey(0) 

は、ここで私はプログラムにAB/wの対比脳の画像を送るとき（私は腫瘍が黒で表示されますので、脳を対比し、脳の他の部分に何が起こるかですほとんど白です）：

腫瘍は完全な円ではありませんが、明らかに脳の中で最も大きな「ブロブ」です。オープンCVはそれを拾うことができません、それは黒い外殻と白いコアを持っていると思われます。

私はより多くの区別可能な腫瘍を選択した場合のみ、大きな白いインナーコアなしで、それは腫瘍を拾うことができます。

アドバイスはありますか？私は元の画像からこれらのブロブを（一度正確に動作するように）はがすことができ、各スライスの2D腫瘍から脳の3D腫瘍全体を再構成するためにキーポイントを使用する必要があります。私はそのステップから少し離れていますが、このブロブ検出器の問題は2Dと3Dの間の重要なリンクです。すべての助けを感謝します！

Answer 1

probaply最も大きなブロブは、頭蓋骨自体です。 もしあなたが一番大きいブロブを気をそらさせ、次の大きなものを外側に保つならば