難しいSQLクエリすべてとすべての場合

Question

私はSQLクエリを書く方法がわかりません。

考えるデータ：
いくつかの形質識別子の整数は - 私は特定の形質に割り当てられているSNPを見つけるするなdomain_idを探しています1、447

としましょう。 SNPは、genomic_posがドメインstartとendとの間にあり、chr_idが同じドメインの場合はドメインにあります。 2例の任意とすべてがあります

• 私はすべての与えられた特性からのSNPを見つけることが可能なドメインを探しているすべての場合。言い換えれば、すべての形質はドメイン内にsnp表現を持っています。
• 任意ケース私は特定のドメインからsnpsを見つけることができるドメインを探しています。つまり、ドメイン内の任意の特性のsnp表現を1つだけ見つけるだけで十分です。

私はすでにどの場合を解決してきましたが、私はですべてケースを立ち往生:(

ここは、任意のコードです：ここでは

SELECT DISTINCT domains.domain_id 
FROM snps JOIN traits_snps ON snps.snp_id  = traits_snps.snp_id 
     JOIN traits  ON traits.trait_id = traits_snps.trait_id 
     JOIN chromosomes ON snps.chr_id  = chromosomes.chr_id 
     JOIN domains  ON domains.chr_id = chromosomes.chr_id 
WHERE traits.trait_id in (447,1) -- <-- HERE GOES TRAIT IDS 
    AND genomic_pos BETWEEN start AND end 
    AND domains.chr_id = snps.chr_id; 

が私のDBでありますSQLiteで

Answer 1

私が正しく理解していれば、あなたはgroup byとhavingで欲しい：

SELECT d.domain_id 
FROM snps s JOIN 
    traits_snps ts 
    ON s.snp_id = ts.snp_id JOIN 
    traits t 
    ON t.trait_id = ts.trait_id JOIN 
    chromosomes c 
    ON s.chr_id = c.chr_id JOIN 
    domains d 
    ON d.chr_id = c.chr_id AND 
     d.chr_id = s.chr_id -- JOIN conditions should be in ON clauses 
WHERE t.trait_id in (447, 1) AND -- <-- HERE GOES TRAIT IDS 
     genomic_pos BETWEEN start AND end 
GROUP BY d.domain_id 
HAVING COUNT(DISTINCT t.trait_id) = 2; 

Answer 2

WHERE EXISTSを使用し、一部のデータが他のテーブルに存在しているドメインを検索するに。

いかなる場合：

select domain_id 
from domains d 
where exists 
(
    select * 
    from snps 
    where snps.chr_id = d.chr_id 
    and snps.genomic_pos between d.start and d.end 
    and snps.snp_id in (select snp_id from traits_snps where trait_id in (447, 1)) 
); 

ALL場合：形質の少なくとも一つに関連して与えられた範囲内のSNPを持つドメインの検索に関連して、与えられた範囲内のSNPを持つドメインを探します形質のすべて：

select domain_id 
from domains d 
where exists 
(
    select * 
    from snps 
    where snps.chr_id = d.chr_id 
    and snps.genomic_pos between d.start and d.end 
    and snps.snp_id in 
    (
    select snp_id 
    from traits_snps 
    where trait_id in (447, 1) 
    group by snp_id 
    having count(distinct trait_id) = 2 
) 
);