igraph(R)の非常に基本的な問題は、ノードIDの名前の変更です。igraph R頂点IDが変更される
たとえば、以下のグラフがエッジゲルの形で表示されます。
10,12
10,14
12,14
12,15
14,15
12,17
17,34
17,100
100,34
各ノードのローカルクラスタリング係数を計算します。最初に私はオブジェクトgのedgelistをreadcsvで読みました。次に、次のコマンドを使用して、各ノードのローカルCCをダンプします。
write.csv(transitivity(g,type="local"),file="DumpLocalCC.csv")
さて問題は、IGRAPHは、ノードIDは1から始まり、私は今、私がidは何をしているノード毅然とすることができますどのように出力
"","x"
"1",NA
"2",0.333333333333333
"3",0.333333333333333
"4",0.333333333333333
"5",1
"6",1
"7",1
を以下の取得に変更しますか?つまり、出力ファイルの7が100または34を指している場合ですか? とにかく、igraphに10,34,100などの実際のノードIDとそれぞれのローカルCCをダンプするように強制できますか?
私はグーグルで、人々はnodeidsを保存するために "V(g)$ name < - as.character(V(g))"を提案しました。私はしかし、私はそれを正しく使用していないと思った。 また、データが大きいので、nodeidsを手作業で変更して1 ...自分自身にするのは嫌です。
P.s:Here同様の質問がありました。これらの数値を頂点名として割り当てることが推奨されています。 どうすればいいですか? 誰かがそれを例示することができますか?
別の同様の質問this(私はその似たような疑問を理解しています)が、問題を開くように提案されました。これが解決されたかどうかはわかりません。
ありがとうございます。
あなたは(適切[再現可能な例]を提供する場合、それはあなたを助けるために容易になるだろうhttp://stackoverflow.com/questions/5963269/how-to-make-a-great-r-reproducible -example)をコピーしてRに貼り付けてテストすることができます。グラフオブジェクトの作成方法を正確に表示します。 – MrFlick
エッジリストが提供されました。私はそれを読むために次のコードを使用しています DF < - read.csv( "PATH OF EDGELIST.csv") g < - graph.DF(advice_data_frame)以上私はどのようにクラスター係数(推移性)を計算しているのかの例を示しました。それをファイルにダンプする – raj