Pythonでバイナリファイルを読む

Question

Pythonで特に読みにくいバイナリファイルが見つかりました。手伝って頂けますか？ 私は、Fortran 90で簡単に詳細に

int*4 n_particles, n_groups 
real*4 group_id(n_particles) 
read (*) n_particles, n_groups 
read (*) (group_id(j),j=1,n_particles) 

によって読み取られ、このファイルを、読む必要が、ファイル形式は次のとおりです。

Bytes 1-4 -- The integer 8. 
Bytes 5-8 -- The number of particles, N. 
Bytes 9-12 -- The number of groups. 
Bytes 13-16 -- The integer 8. 
Bytes 17-20 -- The integer 4*N. 
Next many bytes -- The group ID numbers for all the particles. 
Last 4 bytes -- The integer 4*N. 

は、どのように私は、Pythonでこれを読むことができますか？私はすべてを試みたが、それは決して働かなかった。私はPythonでこのバイナリファイルを読んで、私が使用する必要があるデータを保存するf90プログラムを使用する可能性はありますか？

Answer 1

読むこのようなバイナリファイルの内容：

with open(fileName, mode='rb') as file: # b is important -> binary 
    fileContent = file.read() 

その後、struct.unpackを使用してバイナリデータを "解凍"：

開始バイト：struct.unpack("iiiii", fileContent[:20])

ボディ：見出しのバイトを無視して、末尾のバイト（= 24）。残りの部分はボディのバイト数を知るためにボディを形成し、4で整数除算を行います。得られる商はアンパック方法の正しい形式を作成するために、文字列'i'を乗じて：

struct.unpack("i" * ((len(fileContent) -24) // 4), fileContent[20:-4]) 

エンド・バイト：struct.unpack("i", fileContent[-4:])

Answer 2

一般的に、これはPythonのstructモジュールを使用して調べることをお勧めします。これはPythonの標準であり、質問の仕様をstruct.unpack()に適した書式設定文字列に変換するのは簡単です。

フィールド間に「見えない」パディングがある場合は、それを把握してunpack()コールに含めるか、間違ったビットを読み込む必要があります。解凍するために何かを持っているために、ファイルの内容を読み込む

は非常に簡単です：

import struct 

data = open("from_fortran.bin", "rb").read() 

(eight, N) = struct.unpack("@II", data) 

これは、彼らがファイル（なしパディングまたは余分の先頭に開始すると仮定すると、最初の2つのフィールドをアンパックデータ）、およびネイティブバイトオーダー（@シンボル）を前提としています。書式化文字列のIは、「符号なし整数、32ビット」を意味します。

Answer 3

numpy.fromfileを使用すると、テキストファイルとバイナリファイルの両方からデータを読み取ることができます。最初に、numpy.dtypeを使用してファイル形式を表すデータ型を作成し、numpy.fromfileを使用してファイルからこの型を読み取ります。

Answer 4

import pickle 
f=open("filename.dat","rb") 
try: 
    while True: 
     x=pickle.load(f) 
     print x 
except EOFError: 
    pass 
f.close()