BiopythonはDerwent GENESEQ形式を解析できますか？

Question

Derwent GENESEQデータベースからファイルを解析しようとしています。

ファイルはおそらくEMBLで書式設定されていますが、小さな違いがあり、SeqIO.parse('foo.dat', 'embl')が壊れています。誰かがBiopythonや他のPythonライブラリでこれらのファイルを正常に解析しましたか？

Answer 1

私はBiopython EMBLパーサーをサブクラス化し、自分のGENESEQパーサーをハックアップしました。