PBSジョブスクリプトでウォールタイムを取得する

Question

PBSキューイングシステムにジョブスクリプトをサブミットする場合、walltimeは自動的に、またはユーザーによって指定されます。 via

#PBS -l walltime=1:00:00 

この時間にジョブスクリプトからアクセスできるかどうかです。このウォールタイムを取得するには、環境変数や他の方法がありますか？

最終的には、キューイングシステムによってジョブが強制終了されないように、何らかの作業を行うのに十分な時間があるかどうかをジョブスクリプトが時折判断する必要があります。

更新：ユーザーがリソースリストにwalltimeを指定した場合、少なくとも

、私は（bashのために働いて）次の回避策を提案することができます

からwalltimeを解析し

read _ _ PBS_WALLTIME <<< `qstat -f $PBS_JOBID | grep "Resource_List.walltime"` 

qstatが出力され、PBS_WALLTIME変数に値が格納されます。したがって、コマンド

echo $PBS_WALLTIME 

これは環境変数$ PBS_WALLTIMEに格納されて

1:00:00 

Answer 1

のようなものが得られます。

もちろん、それはTORQUEのためですが、使用しているPBSキューイングシステムが不明です。

Answer 2

私はこれに対する答えを探していました。上記のコメントは、私にはかなりうまくいくように思えました。あなたは、qstatのを使用してのsedでそれから適切な情報をつかむことができます。

qstat -f $PBS_JOBID | sed -rn 's/.*Resource_List.walltime = (.*)/\1/p' 

あなたのPBSスクリプトでこれを置くことは値をプリントアウトし、あなたが変数で、この出力を保存するために、標準のbashを使用することができます。

また、これは、ジョブに割り当てられたメモリ量などのPBS_ *環境変数からは利用できないその他の情報を取得するためにも使用できます。