2016-04-14 11 views
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私はmatplotlibアニメーション関数を使用してリアルタイムデータを表示しています。数分実行した後、私はPythonが使用していたメモリが這い上がっていることに気付きました。私はいくつかのアニメーションの例に戻って、それらが私のコンピュータ上で同じ問題を抱えているかどうかを調べることに決めました。matplotlibアニメートメモリリーク

animate_decay.pyの例を使用して、FalseからTrueに変更を繰り返すと、リアルタイムデータプログラムの同じ問題がシミュレートされます。 1つの変更を加えたコードがあります。

import numpy as np 
import matplotlib.pyplot as plt 
import matplotlib.animation as animation 

def data_gen(t=0): 
    cnt = 0 
    while cnt < 1000: 
     cnt += 1 
     t += 0.1 
     yield t, np.sin(2*np.pi*t) * np.exp(-t/10.) 

def init(): 
    ax.set_ylim(-1.1, 1.1) 
    ax.set_xlim(0, 10) 
    del xdata[:] 
    del ydata[:] 
    line.set_data(xdata, ydata) 
    return line, 

fig, ax = plt.subplots() 
line, = ax.plot([], [], lw=2) 
ax.grid() 
xdata, ydata = [], [] 


def run(data): 
    # update the data 
    t, y = data 
    xdata.append(t) 
    ydata.append(y) 
    xmin, xmax = ax.get_xlim() 

    if t >= xmax: 
     ax.set_xlim(xmin, 2*xmax) 
     ax.figure.canvas.draw() 
    line.set_data(xdata, ydata) 

    return line, 

ani = animation.FuncAnimation(fig, run, data_gen, blit=False, interval=10, 
           repeat=True, init_func=init, save_count=0) 
plt.show() 

私はMac(OS X 10.10)を使用しており、PythonがActivity Monitor経由で使用するメモリを監視しています。アニメーションが繰り返し繰り返されるにつれ、Pythonはますます多くのメモリを占有しています。数分後、Pythonは300Mb以上を使用していました。

この問題は、Memory usage for matplotlib animationの質問とよく似ていますが、回答されませんでした。

実行機能にガベージコレクションを挿入しようとしましたが、これは役に立たなかった。私はpython 2.7とpython 3.5でmatplotlibも同じ結果を試してみました。それ以上の提案はありますか?この動作は期待されていますか?

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私はWin10、Pythonの2.7、アナコンダ64ビットのIpythonノートブックに変更されていないコードを実行している、と私はわずかな変動で、87.1メガバイトを使用してプロセスを参照してくださいが、常に戻って最初の時に同じ番号を持ってきます数分。 10分以上の後に87.6 MB。 – roadrunner66

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Strange。私はコードをどのように実行するかにかかわらず、メモリの問題を抱えています。 Python、ipythonノートブック、またはコマンドラインに貼り付けられます。私もanaconda 4.0を使用しています。たぶんデフォルトのグラフィックスと関係がありますか? –

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Win7、Anaconda 3.11.0-dirty、Qt4Aggバックエンドを搭載したIpythonノートブック2.7は、15分ほどで68.8MBから69.5MBになりました。問題を再現できません。 – ljetibo

答えて

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問題は、Macでmatplotlibが使用するデフォルトのバックエンドです。 (OS 10.10)それはMacOSXの "

Qt4AggまたはTkAggのいずれかへの切り替えが正常に動作している私のミニMacでは

import matplotlib 
matplotlib.get_backend() 

:デフォルトのバックエンドはで見つけることができます。これらの2行を前のコードの先頭に挿入します。

import matplotlib 
matplotlib.use('TkAgg') 
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これは実際にメモリ消費の問題を修正しましたか? – bretcj7