glmer
の機能がlme4
から別のマシンで異なる結果を生ずる理由はありますか?マシン内のハードウェアは実質的に異なりますが、すべて同じOS、R、およびパッケージのバージョンを実行しています(これは実際には当てはまりません)。異なるマシンで異なった結果が得られる(非決定論的)
この式には、グループ化された2項応答変数と22個の連続した固定効果があり、それらはすべて同じスケールであり、いくつかのランダムな効果があり、文字列であり、logit
リンク機能を使用しています。クロスバリデーション抜かす1に設定し、電車やテストデータを使用している場合
cbind(ill, not_ill) ~ 0 + fix1 + fix2 + ... + fix22 + (1|id/region/country) +
(1|season)
、私は非常に同様の結果を得ます。しかし、1台のマシンでは、警告なしで一貫してクリーンな出力が得られます。別のテストでは、テストごとにコンバージェンスの警告が表示されます。
N.B. sessionInfo()
マシン1(これはいい結果を出して1
R version 3.3.1 (2016-06-21)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 16.04.1 LTS
locale:
[1] LC_CTYPE=en_GB.UTF-8 LC_NUMERIC=C
[3] LC_TIME=en_GB.UTF-8 LC_COLLATE=en_GB.UTF-8
[5] LC_MONETARY=en_GB.UTF-8 LC_MESSAGES=en_GB.UTF-8
[7] LC_PAPER=en_GB.UTF-8 LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_GB.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] blmeco_1.1 arm_1.9-1 MASS_7.3-45 lme4_1.1-12 Matrix_1.2-7.1
loaded via a namespace (and not attached):
[1] minqa_1.2.4 coda_0.18-1 abind_1.4-5 Rcpp_0.12.7
[5] MuMIn_1.15.6 splines_3.3.1 nlme_3.1-128 grid_3.3.1
[9] nloptr_1.0.4 stats4_3.3.1 lattice_0.20-34
マシン2(されていないを追加:電車/テスト・セットは、マシン間
EDIT同一であり、とても良い結果)
R version 3.2.3 (2015-12-10)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 16.04.1 LTS
locale:
[1] LC_CTYPE=en_GB.UTF-8 LC_NUMERIC=C
[3] LC_TIME=en_GB.UTF-8 LC_COLLATE=en_GB.UTF-8
[5] LC_MONETARY=en_GB.UTF-8 LC_MESSAGES=en_GB.UTF-8
[7] LC_PAPER=en_GB.UTF-8 LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_GB.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] blmeco_1.1 arm_1.9-1 MASS_7.3-45 lme4_1.1-12 Matrix_1.2-3
loaded via a namespace (and not attached):
[1] minqa_1.2.4 coda_0.18-1 abind_1.4-5 Rcpp_0.12.7
[5] MuMIn_1.15.6 splines_3.2.3 nlme_3.1-124 grid_3.2.3
[9] nloptr_1.0.4 stats4_3.2.3 lattice_0.20-33
明らかに、私が逃したいくつかの違いがありますので、私はそれを修正し、出力に変更があるかどうか確認します。相違点のうち、Matrix
は、(おそらく)それがlme4
という依存関係の問題を引き起こしている可能性が最も高いものです。ここに私を導いたコメントをありがとう。
再現可能な例を提供してくださいhttp://stackoverflow.com/help/mcveこれは、両方のコンピュータで同じシード値を設定したと言われています。 –
これは機密上の理由から私が提供できる情報です。私は自分の問題に対する解決策を探しているわけではなく、私が理解していないことを記述したものに対しては、決定的ではない要素があるかどうかを理解しようとしています。私はこれが本当に下院を正当化するとは思わない。 – RockJake28
それは実際にどのように動作しないのですか。仕事を持っている人は誰でも、99.9%の機密データを持っています。実際のデータでなくても問題が反映されるように、公開データ、自己作成データ、または盲検データを使用して**再現可能な例**を作成する時間と労力を費やすのはあなたの負担です。私は再現可能な例を含んでいないため、この質問を議論の対象外とすることに投票しています。 –