Rは、他のパッケージを最初にアンロードしなければならないというエラーを挙げて、インストールされたパッケージを読み込みません。

Question

私はここで直面している問題を深く理解しておらず、コメントを更新/応答する際に忍耐してください...ありがとう、

最近「metagenomeSeq」というパッケージ（URL：http://www.cbcb.umd.edu/software/metagenomeSeq）をインストールしようとしました。

> biocLite("metagenomeSeq") 
BioC_mirror: https://bioconductor.org 
Using Bioconductor 3.2 (BiocInstaller 1.20.1), R 3.2.5 (2016-04-14). 
Installing package(s) ‘metagenomeSeq’ 
... 
[snippped] 
... 
* installing *source* package ‘metagenomeSeq’ ... 
** R 
** data 
** inst 
** preparing package for lazy loading 
** help 
*** installing help indices 
** building package indices 
** installing vignettes 
** testing if installed package can be loaded 
* DONE (metagenomeSeq) 

しかし、パッケージをロードしようとすると、次が得られます：

source("http://bioconductor.org/biocLite.R") 
biocLite("metagenomeSeq") 

インストールは明らかに成功している：このパッケージには、インストールするRスクリプト biocLiteを使用して、独自のインストールルーチンを使用しています

> library("metagenomeSeq") 
Loading required package: Biobase 
Error in unloadNamespace(package) : 
    namespace ‘Biobase’ is imported by ‘DESeq2’, ‘genefilter’, ‘multtest’, ‘annotate’, ‘geneplotter’, ‘AnnotationDbi’ so cannot be unloaded 
Error in library(pkg, character.only = TRUE, logical.return = TRUE, lib.loc = lib.loc, : 
    Package ‘Biobase’ version 2.26.0 cannot be unloaded 

IはRのv3.2.5とRstudio v099.491を使用しています。オペレーティングシステム：Ubuntuの14.04。パッケージは以下のとおりです。

library("scales") 
library("ape") 
library("ggplot2") 
library("RColorBrewer") 
library("igraph") 
library("vegan") 
library("gridExtra") 
library("cowplot") 
library("RAM") 
library("plyr") 
library("stringr") 
library("gridExtra") 
library("ggdendro") 
library("reshape2") 
library("xtable") 
library("knitr") 
library("phyloseq") 
library("indicspecies") 

編集1：

パッケージのロード私が最初に他のパッケージをロードせずにRスタジオの新鮮なインスタンスを開くとき。 Rのパッケージの依存関係がアンロードされるようにそれらの依存関係を必要とする他のパッケージとの競合を持ってすることが可能ですか？私は以前これを見たことがない。

編集2：私が使っていた含まれたパッケージ。

Answer 1

レイジー修正：ライブラリを削除し、 "再構築" と "RAM"（RAMがリシェイプに依存していた）私の問題を軽減します。