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msms.exeがこの単純なスクリプトでの動作を停止しました。デバッグにお役立てください。私は別のpdb、同じ結果でそれを試してみました。 ResidueDepth.pyをご覧ください。AssertionError:コマンドを使用してサーフェスファイルを生成できませんでした
てAssertionError: MSMS -probe_radius 1.5 C -if:\ Users \ユーザーアフマド\のAppData \ローカル\一時\ tmp2pa74le2 -of C:コマンドを使用して、表面のファイルの生成に失敗しましたユーザーを\ \アフマド\のAppData \ローカル\ Tempにし\ tmpf7zqwkg6> C:\ Users \ユーザーのウィンドウ上で実行することはできませんbashスクリプトであるアフマド\のAppData \ローカル\の一時\
from Bio.PDB import PDBParser, ResidueDepth
p = PDBParser()
s = p.get_structure("X", '1crn.pdb')
model = s[0]
rd = ResidueDepth(model, '1crn.pdb')
print(rd[(chain_id, res_id)])