Bioconductor highthroughputassaysワークフローをインストールすると、RGLエラーが発生しますし、私は次の（と<a href="https://www.bioconductor.org/help/workflows/highthroughputassays/#flow-cytometry" rel="nofollow noreferrer">described here</a>として）としてbioconductorワークフロー「highthroughputassays」をインストールしようとすると

Question

のロードに失敗：ちょうど

> source("http://bioconductor.org/workflows.R") 
> workflowInstall("highthroughputassays") 

それは依存パッケージの多くをインストールされますが、インストールを終了する前に、次のエラーが表示されます。

No man pages found in package ‘highthroughputassays’ 
*** installing help indices 
** building package indices 
** installing vignettes 
** testing if installed package can be loaded 
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rgl', details: 
call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) 
error: unable to load shared object '/Users/johansenkh/Library/R/3.3/library/rgl/libs/rgl.so': 
dlopen(/Users/johansenkh/Library/R/3.3/library/rgl/libs/rgl.so, 6): Library not loaded: /opt/X11/lib/libGLU.1.dylib 
Referenced from: /Users/johansenkh/Library/R/3.3/library/rgl/libs/rgl.so 
Reason: image not found 
Error: loading failed 
Execution halted 
ERROR: loading failed 
* removing ‘/Users/johansenkh/Library/R/3.3/library/highthroughputassays’ 
Warning in install.packages : 
installation of package ‘highthroughputassays’ had non-zero exit status 

The downloaded source packages are in 
‘/private/var/folders/hb/sc3x6vtj0ys009qnyplbp2_h1g5hgm/T/RtmpDkWkRH/downloaded_packages’ 

これらのエラーのため、ワークフローはロードされません。

library(flowStats) 

は、上記のパッケージのインストール後も同様のエラーが発生します。

library(rgl)をしようとすると（（最新バージョンは3.3.2です）、すべての最新のOS Xで、そのうちの1はRの3.3.1バージョンを持っていた）

を私は3種類のMacコンピュータ上でそれを試してみました私は次のエラーを取得する：

問題が積載「RGL」とあった：次のように

Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rgl', details: 
call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) 
error: unable to load shared object '/Users/johansenkh/Library/R/3.3/library/rgl/libs/rgl.so': 
dlopen(/Users/johansenkh/Library/R/3.3/library/rgl/libs/rgl.so, 6): Library not loaded: /opt/X11/lib/libGLU.1.dylib 
Referenced from: /Users/johansenkh/Library/R/3.3/library/rgl/libs/rgl.so 
Reason: image not found 
Error: package or namespace load failed for ‘rgl’ 

Answer 1

が、私は問題を解決しました。

XQUARTZ（www.XQUARTZ.com）をインストールし、続いてOS Xを再起動すると（ログアウトしてログイン）、rgl-packageが機能します。その後、上記のようにワークフローがインストールされます。