サンプル$ sampleに含まれるフォルダ名のリストに "_quants"を追加します。私は、次を使用する場合:サブディレクトリのリストでfile.path()を使用するには
files <- file.path(dir, "quants", samples$sample, "_quants")
> dir
[1] "E:/ubuntu-shared/salmonTutorial/"
> samples$sample
[1] DRR016125 DRR016126 DRR016127 DRR016128 DRR016129 DRR016130 DRR016131 DRR016132 DRR016133 DRR016134 DRR016135 DRR016136 DRR016137 DRR016138 DRR016139
[16] DRR016140
16 Levels: DRR016125 DRR016126 DRR016127 DRR016128 DRR016129 DRR016130 DRR016131 DRR016132 DRR016133 DRR016134 DRR016135 DRR016136 DRR016137 ... DRR016140
を私が取得:
[1] "E:/ubuntu-shared/salmonTutorial//quants/DRR016125/_quants"
がどのように私は、二重//を削除し、 "_quants" を追加します "DRR016125" 希望得るためにfile.path()を使用します:
[1] "E:/ubuntu-shared/salmonTutorial/quants/DRR016125_quants"
[2] "E:/ubuntu-shared/salmonTutorial/quants/DRR016126_quants"
二重の '/'を削除するには、最初のオブジェクト 'dir'に後続の'/'を含めないでください。これで、 'file.path(dir、quants"、paste0(samples $ sample、 "_quants")) ' – Frank