PySBをAnaconda3とWindows7で使用しようとしています。私は関連するdepedencies(numpy、scipy、sympi、perl)を作業環境に追加しました。しかし、私はBioNetGenプログラムに苦労しています。私はそれをダウンロードし、BNGへのパスを追加しましたが、自分の環境に追加することはできません。ここでAnaconda環境にBioNetGenを追加する
は、私が試したものです:
>conda search bionetgen
Using Anaconda Cloud api site http....
Fetching package metadata...
その後何も起こりません。その後
>pip install bionetgen
Collecting bionetgen
エラーメッセージ:
Could not find a version that satisfies the requirement bionetgen (from versions:)
No matching distribution found for bionetgen
最後に、私が試した:私は手動でBioNetGenプログラムを開き、GUIを取得することができますしかし
>easy_install bionetgen
Processing bionetgen...
error: could not find a setup script in C:\....
ので、私はそれが正しくインストールされていると仮定します。私はちょうどそれをアナコンダに加える方法を知らない。 BioNetGenがperl上で動作するという問題はありますか?
pysbモデルを視覚化するための仮想ボックスがありますが、手動で依存関係をインストールすることをお勧めします。
ありがとうございました!
これはPythonコミュニティのための質問ではないと思います。おそらく、BioNetGenのドキュメントを読んで、Pythonへの接続がどのように機能するかを理解する必要があります。私はBioNetGenがPythonパッケージであることも知らない。 – Kartik
ここにあります:http://bionetgen.org/index.php/Using_the_BNGConsole#An_example_using_Pythonこれによると、 'pexpect'パッケージが必要です。これは、' pip'がインストールされていて、ドキュメントによると、https://pexpect .readthedocs.io/ja/stable/install.html – Kartik