Question

MySQLデータベースに接続するRプロシージャを実行しています。これは、パッケージRMySQLを使用しており、すべて正常に動作しています。しかし、今、私はRSCRIPT同じ手順トラフを実行すると、接続パラメータを渡したい、この

library(RMySQL) 
con_str <- "MySQL(), user = 'root', password = '', dbname = 'nepal_statagri', host = 'localhost'" (this is the string I want to pass as a parameter to RScript) 
mysqlconnection = dbConnect(con_str) 

のような、それは仕事をdoesntの、そして私がメッセージを得る：に

「エラー（関数（クラス、FDEF、mtable）：署名 ための機能のために 継承された方法を見つけることができません 'dbConnectの' ' "文字"'」

何C私は何ですか？

Answer 1

エラーメッセージに示すように、文字ベクタを渡してデータベースに接続しようとしています。それは動作しません。

1つのオプションは、スクリプトの中で正しい構文を使用することです：

library(RMySQL) 
mysqlconnection <- dbConnect(RMySQL::MySQL(), 
          user = 'root', 
          password = '', 
          dbname = 'nepal_statgri', 
          host = 'localhost') 

ただし、Rscriptを使用して言及。私の理解では、接続の詳細を格納していないRファイルを持つことに興味がありますが、シェル端末からの引数としてこれらの詳細を渡したいと思っています。

これを行うには、docoptパッケージを使用して、Rスクリプトのコマンドラインインターフェイスを簡単に作成できるようにすることもできます。たとえば、ファイルに次のように保存した場合connect_mysql.R呼ば：

'usage: connect_mysql.R [--user <user> --password <pwd> --db <database> --host <host>] 

options: 
    --user username 
    --password password 
    --db database 
    --host host 
' -> doc 

library(docopt) 
library(RMySQL) 

opts <- docopt(doc) 

con <- dbConnect(RMySQL::MySQL(), 
      username = opts$user, 
      password = opts$password, 
      dbname = opts$db, 
      host = opts$host) 
dbListTables(con) 
dbDisconnect(con) 

あなたがRscriptを使用してそれを呼び出すと、あなたの接続の詳細を渡すことができるようになります：

Rscript connect_mysql.R --user root --password password --db nepal_statgri --host localhost