非整数インデックスを持つPython Numpy 2d配列

Question

背景：sklearnスペクトルクラスタリングに対応するアフィニティマトリックスを構築しようとしています。

この問題では、numpy配列インデックスが0から始まる整数で、アプリケーションで特定の種類のアプリケーション固有のID（文字列ベースのランダムな例 "abc123"）を使用しているという問題が発生しました。私はすべてのデータポイントでインデックス化された2次元配列を作成したいと思います。たとえば、2つの点points = ["abc123", "xyz456"]が与えられていると、行インデックスと列インデックスがpointsである2dのnumpy配列が得られます。 2点間の距離を簡単に指定できるように、arr["abc123"]["xyz456"] = dist

私はそれをどのように達成することができますか？ありがとうございました。

Answer 1

Pandasははるかにこれを行うと、多くのことができます...

In [41]: import pandas as pd 

In [122]: a = np.random.randint(100, size=(5, 3)) 

In [123]: a 
Out[123]: 
array([[53, 7, 34], 
     [54, 56, 85], 
     [ 0, 11, 83], 
     [63, 28, 88], 
     [65, 19, 44]]) 

In [124]: df = pd.DataFrame(a, index=list('abcde'), columns=list('xyz')) 

In [125]: df 
Out[125]: 
    x y z 
a 53 7 34 
b 54 56 85 
c 0 11 83 
d 63 28 88 
e 65 19 44 

In [126]: df.loc[['a','d'], ['x','y']] 
Out[126]: 
    x y 
a 53 7 
d 63 28 

私たちは常に.valuesアクセサを使用してデータフレームからnumpyの配列を取得することができます。

In [127]: df.values 
Out[127]: 
array([[53, 7, 34], 
     [54, 56, 85], 
     [ 0, 11, 83], 
     [63, 28, 88], 
     [65, 19, 44]]) 

In [128]: df.loc[['a','d'], ['x','y']].values 
Out[128]: 
array([[53, 7], 
     [63, 28]]) 

Answer 2

あなたはキーで辞書を使用することができますが、まだnumpyの配列が必要な場合はdtypeで遊ぶことができます。 doc：

>>> dt = np.dtype([('name', np.unicode_, 16), ('grades', np.float64, (2,))]) 
>>> x = np.array([('Sarah', (8.0, 7.0)), ('John', (6.0, 7.0))], dtype=dt) 
>>> x[1] 
('John', [6.0, 7.0]) 
>>> x[1]['grades'] 
array([ 6., 7.])