2016-04-17 10 views
1

lme4 (1.1-12)を更新した後、varCompパッケージを呼び出すとこのエラーが発生します。エラー:オブジェクト 'sigma'が 'namespace:lme4'によってエクスポートされていません

library(varComp) 
Error : object ‘sigma’ is not exported by 'namespace:lme4' 
Error: package or namespace load failed for ‘varComp’ 

この点に関するご支援をいただければ幸いです。おかげ

編集 ここでは私のsessionInfo()

sessionInfo() 
R version 3.3.0 beta (2016-03-30 r70404) 
Platform: i686-pc-linux-gnu (32-bit) 
Running under: Ubuntu 14.04.3 LTS 

locale: 
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8  LC_NUMERIC=C    LC_TIME=en_US.UTF-8  LC_COLLATE=en_US.UTF-8  
[5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8 LC_PAPER=en_US.UTF-8  LC_NAME=C     
[9] LC_ADDRESS=C    LC_TELEPHONE=C    LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C  

attached base packages: 
[1] stats  graphics grDevices utils  datasets methods base  

other attached packages: 
[1] lme4_1.1-12  Matrix_1.2-4 devtools_1.11.0 

loaded via a namespace (and not attached): 
[1] Rcpp_0.12.4   Formula_1.2-1  roxygen2_5.0.1.9000 magrittr_1.5  cluster_2.0.3  
[6] MASS_7.3-45   mutoss_0.1-10  splines_3.3.0  BiocGenerics_0.12.1 mnormt_1.5-4  
[11] xtable_1.8-2  colorspace_1.2-6 lattice_0.20-33  R6_2.1.2   quadprog_1.5-5  
[16] parallel_3.3.0  broom_0.4.0   latticeExtra_0.6-28 coda_0.18-1   TH.data_1.0-7  
[21] withr_1.0.1   MatrixModels_0.4-1 assertthat_0.1  digest_0.6.9  multtest_2.22.0  
[26] acepack_1.3-3.3  StroupGLMM_0.1.0 phia_0.2-1   scales_0.4.0  lsmeans_2.23  
[31] Hmisc_3.17-3  lmerTest_2.0-30  stats4_3.3.0  survey_3.30-3  munsell_0.4.3  
[36] multcomp_1.4-4  minqa_1.2.4   plyr_1.8.3   dplyr_0.4.3.9000 stringr_1.0.0  
[41] car_2.1-2   tools_3.3.0   grid_3.3.0   nnet_7.3-12   pbkrtest_0.4-6  
[46] nlme_3.1-127  Biobase_2.26.0  gtable_0.2.0  mgcv_1.8-12   quantreg_5.21  
[51] psych_1.5.8   plotrix_3.6-1  DBI_0.3.1   survival_2.39-2  gridExtra_2.2.1  
[56] ggplot2_2.1.0  tidyr_0.4.1   nloptr_1.0.4  reshape2_1.4.1  RColorBrewer_1.1-2 
[61] codetools_0.2-14 rpart_4.1-10  aod_1.3    memoise_1.0.0  sandwich_2.3-4  
[66] stringi_1.0-1  estimability_1.1-1 CompQuadForm_1.4.1 mvtnorm_1.0-5  SparseM_1.7   
[71] foreign_0.8-66  zoo_1.7-12  
+1

申し訳ありませんが、私は答えがありません - ただのコメント。私が言うことは、これは一般的な非互換性ではないということです。私は 'lme4'をv1.1-12に更新し、' varComp'をインストールしました。 Linuxマシンの 'library(varComp)'の後にエラーメッセージは表示されません。 3.3.0ベータ版ではなく公式リリースまたはR(v3.2.5)で試すことができますか? – RHertel

答えて

2

varCompパッケージがRLRsimに依存しています。 RLRsimはS3汎用のsigmaを使用します。これはlme4からR 3.3.0のstatsに移動されました。あなたはR < 3.3.0の下で構築RLRsimのためのWindowsバイナリを使用する場合は、RLRsimlme4に代わりにstatssigmaを探します:

> install.packages("https://cran.r-project.org/bin/windows/contrib/3.2/RLRsim_3.1-2.zip", repos=NULL) 
... 
package ‘RLRsim’ successfully unpacked and MD5 sums checked 
> library(varComp) 
Error : object ‘sigma’ is not exported by 'namespace:lme4' 
Error: package or namespace load failed for ‘varComp’ 

あなたがRLRsimを再インストールする場合は、最新のビルドを取得する必要がありますし、varCompがロードされます:

> install.packages("RLRsim") 
... 
package ‘RLRsim’ successfully unpacked and MD5 sums checked 
... 
> library(varComp) 
> 
関連する問題