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をプリントアウトすることができなかった、私はSYSTEM2(からの出力を見ることができる)によって:knitrは、RコンソールでSYSTEM2()出力
> STAR<-'/opt/NGS/STAR/STAR-2.5.2b/bin/Linux_x86_64_static/STAR'
> system2(STAR,'--version')
STAR_2.5.2b
しかし、私はそのような.Rnwファイルにチャンクを持っている場合:
\begin{frame}[fragile]{Global STAR settings}
<<echo=TRUE, results="asis">>=
STAR<-'/opt/NGS/STAR/STAR-2.5.2b/bin/Linux_x86_64_static/STAR'
system2(STAR,'--version')
@
\end{frame}
ページにはSTAR_2.5.2b
が印刷されていますが、何も印刷されていません。なぜ誰が知っていますか?
'stdout = TRUE'つまり' system2(STAR、 ' - version'、stdout = TRUE)を設定してみてください。 –
あなたの提案をありがとう!それは今修正されました。 –