RuntimeWarningがなくなるまで再試行

Question

MCMCを使用してデータにカーブを合わせようとしています。

私の特定の問題の性質上、時には（コードの1/5を実行する）いくつかの特異点が発生し、コードがRuntimeWarningを発生させ、間違った答えを出す。

/Library/Python/2.7/site-packages/emcee-2.2.1-py2.7.egg/emcee/ensemble.py:335: RuntimeWarning: invalid value encountered in subtract 
/Library/Python/2.7/site-packages/emcee-2.2.1-py2.7.egg/emcee/ensemble.py:336: RuntimeWarning: invalid value encountered in greater 

これは基本的には私がガウスのログをとっており、平均の提案値の1つがデータポイントの1つと等しいために起こります。

これらのランタイム警告が発生しない限り、おそらくtryとexceptを使用して、コードの実行を再試行します。 ありがとう！私は「合格」の両方を使用して入れて、文を「継続」試してみました

while True: 
    try: 
     print "Before mcmc" 
     sampler.run_mcmc(pos, 500) 
     print "After mcmc" 
     break 
    except Exception as e: 
     print "Warning detected" 
     continue 

は内部ループと内側の間、「してみてください「破る」：

編集：私は試してみました@sgDysregulationによってコメントに続き "また、 "Exception"の代わりに "RuntimeWarning"を試しました。

上記スニペットからの出力には、警告が検出されていないことが示されています。

Before mcmc 
/Library/Python/2.7/site-packages/emcee-2.2.1-py2.7.egg/emcee/ensemble.py:335: RuntimeWarning: invalid value encountered in subtract 
/Library/Python/2.7/site-packages/emcee-2.2.1-py2.7.egg/emcee/ensemble.py:336: RuntimeWarning: invalid value encountered in greater 
After mcmc 

Answer 1

をお勧めします：

while True: 
    try: 
     print("Before mcmc") 
     with np.errstate(all='raise'): 
      sampler.run_mcmc(pos, 500) 
     print("After mcmc") 
     break 
    except Exception: 
     print("Warning detected") 
     continue 

Answer 2

あなたが、それは例外であるかのように警告をキャッチするnp.errstateコンテキストマネージャを使用することができ、あなたは、あなたの質問に、これまでに試したものを含める

while True: 
    try: 
     #your code here 

     break 
    except Exception as e: 
     continue