接続ノードの異なるクラスタをよりよく見るために、隣接行列を「ソート」する方法はありますか?隣接行列をソートする方法
私はいくつかの行列を持っていますが、パターンはランダムに分布しているように見えます。現実世界では、私は例えばN個の独立したクラスタを持っていることを知っています(間には何の関係もありません)。
したがって、N個の異なるパターンがあるように隣接行列を見たいと思います。
これは達成可能ですか?
更新: 私は昨日時間がない持っていたが、今ここにいくつかの詳細です:事実で
import networkx as nx
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
G = nx.Graph()
S = {'7064', '7065', '7066', '7067', '7068', '7069', '7070', '7071', '7072', '7073', '7074', '7075', '7076', '7077', '7078', '7079', '7080'}
E = [('7064', '7065'),
('7067', '7068'),
('7067', '7076'),
('7067', '7077'),
('7067', '7078'),
('7067', '7079'),
('7067', '7080'),
('7067', '7081'),
('7068', '7076'),
('7068', '7077'),
('7068', '7078'),
('7068', '7080'),
('7068', '7081'),
('7069', '7075'),
('7070', '7072'),
('7070', '7074'),
('7071', '7074'),
('7076', '7077'),
('7076', '7078'),
('7076', '7079'),
('7076', '7080'),
('7076', '7081'),
('7077', '7078'),
('7077', '7079'),
('7077', '7080'),
('7077', '7081'),
('7078', '7079'),
('7078', '7080'),
('7078', '7081'),
('7079', '7080'),
('7079', '7081'),
('7080', '7081')]
G.add_nodes_from(S)
G.add_edges_from(E)
adj_matrix = nx.adjacency_matrix(G).toarray()
plt.imshow(adj_matrix)
、それは対称行列だと私は上三角の世話(サンプル対それ自身)。
sub_graphs = list(nx.connected_components(G))
nb_clusters = len(sub_graphs) # total number of sub graphs, including isolated points, there is here 2 isolated points. All other are at least linked with min 1 other point.
I 6「ブロブ」があるように見えるように隣接行列をたい(それらの二つが2つの分離点のための単一のピクセルであろう)。現在、上三角では視覚的に離れた12の領域が表示されています(実際には行列はOKですが、実際のサブグラフの数に合わせるために再配置したいと考えています)
コード内ではどのように隣接行列が表されていますか?使用しているコードを表示できますか? – mkrieger1
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