awkコマンドループ

Question

私のファイルリストは以下のようなものです：

12as.pdb 
132l.pdb 
135l.pdb 
13pk.pdb 

私はこのようなコマンドを持っている：私は以下のように、このコマンドのペアごとに生成するループのbashを書きたい

awk 'FNR==NR{a[$1$2]=$3;next} ($1$2 in a) {print $1,$2,a[$1$2],$3}' file1 file2 

：

を

awk 'FNR==NR{a[$1$2]=$3;next} ($1$2 in a) {print $1,$2,a[$1$2],$3}' 12as.pdb 132l.pdb 

    awk 'FNR==NR{a[$1$2]=$3;next} ($1$2 in a) {print $1,$2,a[$1$2],$3}' 12as.pdb 135l.pdb 

    awk 'FNR==NR{a[$1$2]=$3;next} ($1$2 in a) {print $1,$2,a[$1$2],$3}' 12as.pdb 13pk.pdb 

誰でもそのbashスクリプトを書いて、私を助けてくれますか？

Answer 1

これは、起動時にそれを受け取り、それがどのように進むかを教えてくれるスクリプトの例です。あなたがサンプルInput_file（s）と出力に関する多くの情報を私たちに知らせていないので、あなたの質問に基づいてここに答えがあります、awksを何度も作成しても、関数を作成することができました。

#!/bin/bash 
CHECK(){ 
awk 'FNR==NR{a[$1$2]=$3;next} ($1$2 in a) {print $1,$2,a[$1$2],$3}' "$1" "$2" 
} 

CHECK 12as.pdb 132l.pdb 
CHECK 12as.pdb 135l.pdb 
CHECK 12as.pdb 13pk.pdb 

だからロジックは、関数がawkコードを入れて作成し、それを引数としてファイル名を渡し、あなたが渡したい別のファイル名で、その関数を呼び出すです。

Answer 2

のみ2番目のファイルは可変であるので、あなたにも、bashのループに

for f in {1321,1351,13pk}.pdb; 
do 
    awk '....' 12as.pdb $f; 
done 

を行うawk[$1,$2]と($1,$2) in aから$1$2 in aへのスクリプトの変更[$1$2]あなたはあなたに